RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 PNMA5Q96PV4 448 aa14.59□□□□□ -0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.59□□□□□ -0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.59□□□□□ -0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF181Q9P0P0 153 aa14.59□□□□□ -0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.59□□□□□ -0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.58□□□□□ -0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 BICDL2A1A5D9 508 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLRC4O43908 158 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 FLOT1O75955 427 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 VCAM1P19320 739 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 BACE1P56817 501 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 STX17P56962 302 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 UNC13DQ70J99 1090 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 WDR90Q96KV7 1748 aa14.58□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 PTPRAP18433 802 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 EPS15P42566 896 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPP2Q13103 211 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MCM6Q14566 821 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 VSTM4Q8IW00 320 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADSSL1Q8N142 457 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 C12orf42Q96LP6 360 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 GDAQ9Y2T3 454 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.57□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRCPP42785 496 aa14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSD17B4P51659 736 aa14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 PSMD2Q13200 908 aa14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.56□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM86B1E9PN63 330 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MSH4O15457 936 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TPM2P07951 284 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ALAS1P13196 640 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 GHRHRQ02643 423 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SULF1Q8IWU6 871 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRRC15Q8TF66 581 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 LENG9Q96B70 501 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLRG1Q96E93 195 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM47Q96LD4 638 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF536O15090 1300 aa14.55□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 OTOFQ9HC10 1997 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GTH6 734 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYMKA6NI61 221 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 OFD1O75665 1012 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF20AO95235 890 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCNE1P24864 410 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 OAZ1P54368 228 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CEP55Q53EZ4 464 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CPXCR1Q8N123 301 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MED15Q96RN5 788 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYT17Q9BSW7 474 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.54□□□□□ -0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAF1Q9H063 256 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms