RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.28■■□□□ 1.16
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CCDC71-201ENST00000321895 PGM5Q15124 567 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.27■■□□□ 1.16
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CCDC71-201ENST00000321895 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.27■■□□□ 1.16
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CCDC71-201ENST00000321895 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC71-201ENST00000321895 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.27■■□□□ 1.16
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CCDC71-201ENST00000321895 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.26■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 RAB34Q9BZG1 259 aa22.26■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.25■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC71-201ENST00000321895 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.25■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.25■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 TECP42680 631 aa22.25■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.24■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC71-201ENST00000321895 EFCC1Q9HA90 598 aa22.23■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 ITGB5P18084 799 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC71-201ENST00000321895 CNTN2Q02246 1040 aa22.22■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 UBA7P41226 1012 aa22.22■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 CTAGE5O15320 804 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC71-201ENST00000321895 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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CCDC71-201ENST00000321895 PP2D1A8MPX8 630 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 STRNO43815 780 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 TLR2O60603 784 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 GJA10Q969M2 543 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ZIC5Q96T25 663 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 USP25Q9UHP3 1055 aa22.2■■□□□ 1.14
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