RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 EPSTI1Q96J88 318 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB34Q9BZG1 259 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 MROH8Q9H579 483 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 TBX3O15119 743 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PGM5Q15124 567 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP55Q53EZ4 464 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 USP49Q70CQ1 688 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 HAS1Q92839 578 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 AK8Q96MA6 479 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 LCTP09848 1927 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF202O95125 648 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 TXLNAP40222 546 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 TECP42680 631 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 SREBF2Q12772 1141 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 IL31RAQ8NI17 732 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM20AQ96MK3 541 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 TNMDQ9H2S6 317 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMK4Q16566 473 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 DNERQ8NFT8 737 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 TIGD1Q96MW7 591 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 MEIS1O00470 390 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 KCTD2Q14681 263 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR78Q5VTH9 848 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 MSH4O15457 936 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CCND2P30279 289 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 UBA7P41226 1012 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 PDIA5Q14554 519 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 IFNL1Q8IU54 200 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 PDILTQ8N807 584 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 SYCE3A1L190 88 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEB2H3BUK9 544 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 NR3C2P08235 984 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 BCRP11274 1271 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGB5P18084 799 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 GJA10Q969M2 543 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 MMP19Q99542 508 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 SDF4Q9BRK5 362 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 PORCNQ9H237 461 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 PP2D1A8MPX8 630 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CTAGE5O15320 804 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 FCER1AP12319 257 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC25AP30304 524 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 GRM1Q13255 1194 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CREBZFQ9NS37 354 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEMA6NI47 508 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 IWS1Q96ST2 819 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 PANK2Q9BZ23 570 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 EFCC1Q9HA90 598 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 PLXNB2O15031 1838 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF445P59923 1031 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTN2Q02246 1040 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 LONRF3Q496Y0 759 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CNNM3Q8NE01 707 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 UIMC1Q96RL1 719 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 JADE2Q9NQC1 790 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A087X0B3 334 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 STAM2O75886 525 aa23.36■■□□□ 1.33
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