RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 USP14P54578 494 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 Q4G0T1 1027 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 MBOAT7Q96N66 472 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 VCAM1P19320 739 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 RAD54LQ92698 747 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ZHX2Q9Y6X8 837 aa16.37■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ICAM1P05362 532 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ECM1Q16610 540 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 NCAPH2Q6IBW4 605 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 KCNK18Q7Z418 384 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 HOMER2Q9NSB8 354 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 TBX3O15119 743 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ALAS1P13196 640 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 IDEP14735 1019 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 FAM20AQ96MK3 541 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 SYT17Q9BSW7 474 aa16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 MYMKA6NI61 221 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 PSMA7O14818 248 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 SKILP12757 684 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 PTPRAP18433 802 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 CIITAP33076 1130 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 BACE1P56817 501 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ADSSL1Q8N142 457 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 LENG9Q96B70 501 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 MSH4O15457 936 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 CYP3A4P08684 503 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 VSTM4Q8IW00 320 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.35■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 POTEB3A0JP26 581 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 POTECB2RU33 542 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 SEMA3FQ13275 785 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 POTEBQ6S5H4 581 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ERMNQ8TAM6 284 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 DDX12PQ92771 950 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ZNF536O15090 1300 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 TRIM49BA6NDI0 452 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 E9PMD0 336 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 FCER1AP12319 257 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 STK4Q13043 487 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 FILIP1LQ4L180 1135 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 HPS3Q969F9 1004 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 WDR18Q9BV38 432 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 INTS13Q9NVM9 706 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.34■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 NFIBO00712 420 aa16.33■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 ZBED4O75132 1171 aa16.33■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 OFD1O75665 1012 aa16.33■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 HMGCS2P54868 508 aa16.33■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 CDKAL1Q5VV42 579 aa16.33■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 KLRG1Q96E93 195 aa16.33■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 TRIM47Q96LD4 638 aa16.33■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.33■□□□□ 0.21
NICN1-201ENST00000273598 NRDCO43847 1150 aa16.33■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 UNC13DQ70J99 1090 aa16.33■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.33■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 MED24O75448 989 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 ARMCX5Q6P1M9 558 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 MCF2L2Q86YR7 1114 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 HYIQ5T013 277 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 DLK2Q6UY11 383 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 POTEFA5A3E0 1075 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 PLA2G4BP0C869 781 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 POTEIP0CG38 1075 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 NR1I3Q14994 352 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 CEP55Q53EZ4 464 aa16.32■□□□□ 0.2
NICN1-201ENST00000273598 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms