RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226382.3

PHOX2B-201, Transcript of paired like homeobox 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHOX2B, Length 3,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2B-201ENST00000226382 E7EVH7 732 aa22.8■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 CYTH3O43739 400 aa22.8■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 PALMO75781 387 aa22.8■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 NAPAP54920 295 aa22.8■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 CEP89Q96ST8 783 aa22.8■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 KCNB1Q14721 858 aa22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 VWA3BQ502W6 1294 aa22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 SH3GL2Q99962 352 aa22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 LSP1P33241 339 aa22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 BORCS6Q96GS4 357 aa22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 MTA3Q9BTC8 594 aa22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.79■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.78■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.78■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.78■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 TMEM260Q9NX78 707 aa22.78■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 TNS2Q63HR2 1409 aa22.78■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 NOX5Q96PH1 765 aa22.78■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.78■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 BTG4Q9NY30 223 aa22.78■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 POTEMA6NI47 508 aa22.77■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 NR1D1P20393 614 aa22.77■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 POTEDQ86YR6 584 aa22.77■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.77■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.77■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.77■■□□□ 1.24
PHOX2B-201ENST00000226382 OR52Z1P0C646 297 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 NAA35Q5VZE5 725 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 EMBQ6PCB8 327 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 RETREG2Q8NC44 543 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CPP00450 1065 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 KLRC1P26715 233 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 BRINP3Q76B58 766 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 TBC1D5Q92609 795 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 COL18A1P39060 1754 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 MYMKA6NI61 221 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 TMOD1P28289 359 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 ODF2Q5BJF6 829 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 IFT20Q8IY31 132 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 TSPY3P0CV98 308 aa22.75■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 TSPY8P0CW00 308 aa22.75■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 NEBLO76041 1014 aa22.75■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.75■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 GBP6Q6ZN66 633 aa22.75■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.75■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 PLAAQ9Y263 795 aa22.75■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 FLT1P17948 1338 aa22.75■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 TTC36A6NLP5 189 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 SMCO2A6NFE2 343 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 ERFEQ4G0M1 354 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 TBCKQ8TEA7 893 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 TRAF5O00463 557 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 RAD51CO43502 376 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.74■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 KCNK3O14649 394 aa22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CALML4Q96GE6 196 aa22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 ALS2Q96Q42 1657 aa22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 ALS2CLQ60I27 953 aa22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 SV2BQ7L1I2 683 aa22.73■■□□□ 1.23
PHOX2B-201ENST00000226382 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms