RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088716.11

Smarcc1-201, Transcript of SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smarcc1, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ifi207E9Q3L4 978 aa23.44■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Kif5aP33175 1027 aa23.42■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Med7Q9CZB6 233 aa23.42■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Prpsap2Q8R574 369 aa23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Q6PD19 689 aa23.41■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mei4Q8BRM6 389 aa23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Art2bO35975 289 aa23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Abi1Q8CBW3 481 aa23.41■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 A0A286YCQ6 122 aa23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Foxd4Q60688 444 aa23.41■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Haus4Q8BFT2 363 aa23.41■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Krt74Q6IFZ9 495 aa23.4■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Amhr2Q8K592 568 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Cd22P35329 862 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 B4galnt4Q766D5 1034 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 SrlQ7TQ48 910 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mmrn2A6H6E2 943 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Timm44O35857 452 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ncoa7Q6DFV7 943 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Apol6B7ZC55 329 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Pus3Q9JI38 481 aa23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 NpeppsQ11011 920 aa23.39■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Cdk8Q8R3L8 464 aa23.39■■□□□ 1.34
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Smim5Q8BT42 78 aa23.39■■□□□ 1.34
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa23.39■■□□□ 1.33
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ccdc185Q3V118 621 aa23.39■■□□□ 1.33
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 SpertQ32MG2 446 aa23.39■■□□□ 1.33
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Krt5Q922U2 580 aa23.38■■□□□ 1.33
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mrps22Q9CXW2 359 aa23.38■■□□□ 1.33
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Apopt1Q9CQW7 192 aa23.38■■□□□ 1.33
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