RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027988.7

Ccdc3-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc3, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Eme2Q56A04 373 aa20.38■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Trpc6Q61143 930 aa20.38■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 UvssaQ9D479 717 aa20.38■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Acot3Q9QYR7 432 aa20.38■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Peg12Q9WVA7 283 aa20.38■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa20.38■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa20.36■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 IntS13Q8QZV7 732 aa20.36■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Adcy3Q8VHH7 1145 aa20.36■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Magea10A2AMW4 325 aa20.36■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Bend4P86174 541 aa20.36■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa20.36■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Armcx3Q8BHS6 379 aa20.36■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Hirip3Q8BLH7 601 aa20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Fam183bQ5NC57 135 aa20.35■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 BC048507Q80ZS7 89 aa20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Strip1Q8C079 837 aa20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Lrrc57Q9D1G5 239 aa20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 FignQ9ERZ6 759 aa20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Akap2O54931 893 aa20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 MybP06876 636 aa20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Lrsam1Q80ZI6 727 aa20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Vipas39Q8BGQ1 491 aa20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Zbed3Q9D0L1 228 aa20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tmem191cQ9JJB1 302 aa20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Myo1cQ9WTI7 1063 aa20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Wee1P47810 646 aa20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Snap25P60879 206 aa20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pstpip1P97814 415 aa20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Arhgap33Q80YF9 1305 aa20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Spocd1B1ASB6 936 aa20.33■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 CoasyQ9DBL7 563 aa20.33■□□□□ 0.85
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tubb5P99024 444 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pnma5Q5DTT8 618 aa20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Krt42Q6IFX2 452 aa20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 BcrQ6PAJ1 1270 aa20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 GanQ8CA72 597 aa20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 1700020D05RikQ99PB1 294 aa20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mkrn1Q9QXP6 481 aa20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Guca2bO09051 106 aa20.32■□□□□ 0.84
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Lpin2Q99PI5 893 aa20.32■□□□□ 0.84
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