RNA–Protein interactions for RNA: YKR027W

BCH2, Transcript of Member of the ChAPs (Chs5p-Arf1p-binding proteins) family, yeast

Gene BCH2, Length 2,298 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCH2	YKR027W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BCH2	YKR027W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BCH2	YKR027W	PUT2	P07275	575 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ELF1	P36053	145 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SWC5	P38326	303 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YFR020W	P43600	232 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	UBX6	P47049	396 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PIB2	P53191	635 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SRL4	Q03085	281 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	WAR1	Q03631	944 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	MDM30	Q05930	598 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	POS5	Q06892	414 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	GEP3	Q08622	556 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	RRD2	Q12461	358 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SRN2	Q99176	213 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SPS4	P09937	338 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	BOS1	P25385	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	TAE1	P38340	232 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ATG27	P46989	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YGL108C	P53139	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	VPS62	P53285	467 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ORC3	P54790	616 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	UBP16	Q02863	499 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	RRG8	Q06109	277 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	RIP1	P08067	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
BCH2	YKR027W	YKR015C	P36111	568 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YBR053C	P38235	358 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	TSC10	P38342	320 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SIP3	P38717	1229 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	LNP1	P38878	278 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	AIM22	P47051	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	KTR6	P54070	446 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	CAB5	Q03941	241 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	IPK1	Q06667	281 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YPR089W	O13585	888 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PDE2	P06776	526 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PET111	P08468	800 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PMR1	P13586	950 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	KAR4	P25583	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	RAD14	P28519	371 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SUA5	P32579	426 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	STN1	P38960	494 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YER085C	P40058	173 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YIR042C	P40586	236 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	AMA1	P50082	593 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	MRK1	P50873	501 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ROG1	P53118	685 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	YGR126W	P53274	230 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PGA2	P53903	129 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	MED4	Q12343	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	TRM13	Q12383	476 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	MGR1	P25573	417 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	KRE2	P27809	442 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	LAC1	P28496	418 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SIP1	P32578	815 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	SAF1	P38352	637 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PIH1	P38768	344 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	MBB1	P39534	108 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	UBC11	P52492	156 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	CGR1	P53188	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	VOA1	P53262	265 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	BUD17	P53727	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PET117	Q02771	107 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	ROT1	Q03691	256 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	DUS4	Q06063	367 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	TEN1	Q07921	160 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
BCH2	YKR027W	LCB4	Q12246	624 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BCH2	YKR027W	GIS3	Q12418	502 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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