RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL063CYKL063C LPD1P09624 499 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C GLK1P17709 500 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C CHS3P29465 1165 aa2.41□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.41□□□□□ -2.02not detected
YKL063CYKL063C SHP1P34223 423 aa2.41□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C CCT6P39079 546 aa2.41□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C YGR210CP42942 411 aa2.41□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C IMD4P50094 524 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C HHF1P02309 103 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C EXO70P19658 623 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C BUB3P26449 341 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C SPR1P32603 445 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C PIM1P36775 1133 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C NAT2P37293 288 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C FUI1P38196 639 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C BTN2P53286 410 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C TOF1P53840 1238 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C TOF2Q02208 771 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C ESA1Q08649 445 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C YDL012CQ12489 107 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C COR1P07256 457 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C NDI1P32340 513 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C UTH1P36135 365 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C YBL029WP38201 376 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C MEP3P53390 489 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C CAF40P53829 373 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C RLM1Q12224 676 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C YBR126W-AQ8TGU7 68 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C LSB5P25369 354 aa2.37□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C ATP11P32453 318 aa2.37□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C MUD2P36084 527 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C MSR1P38714 643 aa2.37□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C ALG5P40350 334 aa2.37□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C SYG1P40528 902 aa2.37□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C OST1P41543 476 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C YKU80Q04437 629 aa2.37□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C SAM1P10659 382 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C SAM2P19358 384 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C PCL1P24867 279 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C SEF1P34228 1148 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C ISC1P40015 477 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C ALK1P43633 760 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C POP6P53218 158 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C YPT6Q99260 215 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C RSM22P36056 628 aa2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C TCD2P36101 447 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C MBB1P39534 108 aa2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C REE1P40893 198 aa2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C NCA3P46955 337 aa2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C KTR5P53966 522 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C RRN11Q04712 507 aa2.35□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C CDC16P09798 840 aa2.34□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C POP1P41812 875 aa2.34□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C MFB1Q04922 465 aa2.34□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C YEH1Q07804 573 aa2.34□□□□□ -2.03
YKL063CYKL063C CCH1P50077 2039 aa2.34□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C PRP2P20095 876 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C YCR100CP25606 316 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C YHR131CP38835 850 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C TRS85P46944 698 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C YPL199CQ08954 240 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C GAL80P04387 435 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C PET123P17558 318 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C ARO2P28777 376 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C PRS1P32895 427 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C YMR147WP40218 223 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C PAN6P40459 309 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C PRM5P40476 318 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data2.32□□□□□ -2.04not detected
YKL063CYKL063C HUA2Q12134 243 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C YLR108CQ12259 485 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C RAV1P47104 1357 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C MCM10P32354 571 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C MSG5P38590 489 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C VID30P53076 958 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C HAL1Q01766 294 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C YMR018WQ04364 514 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C VPS38Q05919 439 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C RRD2Q12461 358 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C MFT1P33441 392 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C MIX23P38162 196 aa2.3□□□□□ -2.04
YKL063CYKL063C DOT5P40553 215 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.6 ms