RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628883.2

PCBP1-AS1-335, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 891 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 OSBPL3Q9H4L5 887 aa12.01□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PNMA2Q9UL42 364 aa12.01□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SDSP20132 328 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CALML3P27482 149 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CPT1AP50416 773 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CCL23P55773 120 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RPS6P62753 249 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RNF207Q6ZRF8 634 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DNERQ8NFT8 737 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ESR2Q92731 530 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RILPL2Q969X0 211 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 POLR3EQ9NVU0 708 aa12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FGBP02675 491 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NT5C2P49902 561 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PPP2R5BQ15173 497 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RAB30Q15771 203 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 OTOP2Q7RTS6 562 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DGKHQ86XP1 1220 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CPVLQ9H3G5 476 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TNKSO95271 1327 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PTPRSQ13332 1948 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TET1Q8NFU7 2136 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 A6NJR5 290 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ARIH2O95376 493 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IGHDP01880 384 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PSEN1P49768 467 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NUCB1Q02818 461 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PDE4DQ08499 809 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ADGRE1Q14246 886 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PNMA1Q8ND90 353 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RGS22Q8NE09 1264 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SCFD2Q8WU76 684 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ANKS1AQ92625 1134 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 COPS5Q92905 334 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SCLYQ96I15 445 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MAF1Q9H063 256 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PRDM12Q9H4Q4 367 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RAD50Q92878 1312 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ZNF213O14771 459 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 KDM4AO75164 1064 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MYL3P08590 195 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CYP2C9P11712 490 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 USH1GQ495M9 461 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CCDC62Q6P9F0 684 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MSRAQ9UJ68 235 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ABCB11O95342 1321 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 B4E1Z4 1266 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PFKMP08237 780 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TTLL4Q14679 1199 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IQCA1Q86XH1 822 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TBC1D5Q92609 795 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 COL20A1Q9P218 1284 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 B4DLN1 442 aa11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 KPNA6O60684 536 aa11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RABGGTBP53611 331 aa11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms