RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRF-216ENST00000617451 COPS5Q92905 334 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRF-216ENST00000617451 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
PTPRF-216ENST00000617451 PRDM6Q9NQX0 595 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRF-216ENST00000617451 PFKMP08237 780 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 RABGGTBP53611 331 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC178Q5BJE1 867 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 NFRKBQ6P4R8 1299 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 PNMA1Q8ND90 353 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 PPM1EQ8WY54 764 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 ANKS1AQ92625 1134 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 MAF1Q9H063 256 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 TXNP10599 105 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
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PTPRF-216ENST00000617451 IQCA1Q86XH1 822 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 GBF1Q92538 1859 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 KDM4AO75164 1064 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 NUCB1Q02818 461 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 TTLL4Q14679 1199 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
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PTPRF-216ENST00000617451 ZBBXA8MT70 800 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 ARIH2O95376 493 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D5Q92609 795 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 KAT14Q9H8E8 782 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 MYOGP15173 224 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 IGFBP4P22692 258 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC62Q6P9F0 684 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB128Q7Z7B8 93 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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PTPRF-216ENST00000617451 ABCB11O95342 1321 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 B4E1Z4 1266 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 PITPNM1O00562 1244 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 IGHDP01880 384 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 RFC2P35250 354 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 PPP2R2DQ66LE6 453 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 ZSWIM5Q9P217 1185 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 LAMA4Q16363 1823 aa29.15■■■□□ 2.26
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PTPRF-216ENST00000617451 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 COL20A1Q9P218 1284 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 TRANK1O15050 2925 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPRF-216ENST00000617451 HIP1O00291 1037 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPRF-216ENST00000617451 IQCF3P0C7M6 154 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
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PTPRF-216ENST00000617451 THEGQ9P2T0 379 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPRF-216ENST00000617451 REV3LO60673 3130 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPRF-216ENST00000617451 SCN5AQ14524 2016 aa29.13■■■□□ 2.25
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PTPRF-216ENST00000617451 AFG1LQ8WV93 481 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPRF-216ENST00000617451 IWS1Q96ST2 819 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPRF-216ENST00000617451 ACTN1P12814 892 aa29.11■■■□□ 2.25
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PTPRF-216ENST00000617451 BFSP2Q13515 415 aa29.11■■■□□ 2.25
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PTPRF-216ENST00000617451 SEPT14Q6ZU15 432 aa29.11■■■□□ 2.25
PTPRF-216ENST00000617451 ASB2Q96Q27 587 aa29.11■■■□□ 2.25
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC9A7Q96T83 725 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRF-216ENST00000617451 NCOR1O75376 2440 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRF-216ENST00000617451 CA3P07451 260 aa29.07■■■□□ 2.24
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PTPRF-216ENST00000617451 KAT2BQ92831 832 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 UBAC1Q9BSL1 405 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPRF-216ENST00000617451 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
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