RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607016.1

NUDT3-201, Transcript of nudix hydrolase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NUDT3, Length 9,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3-201ENST00000607016 KRT4P19013 534 aa14.66□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 KIF19Q2TAC6 998 aa14.66□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 USH1GQ495M9 461 aa14.66□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.66□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.66□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 PDE6CP51160 858 aa14.66□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 PSMD7P51665 324 aa14.66□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 CDKL2Q92772 493 aa14.66□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.66□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 NBPF26B4DH59 902 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 SRGAP2O75044 1071 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 ADALQ6DHV7 355 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 NBPF15Q8N660 670 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 GGT7Q9UJ14 662 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 SCG2P13521 617 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 SERPINB3P29508 390 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 OCRLQ01968 901 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 CYP4F11Q9HBI6 524 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 CA4P22748 312 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 EPHB1P54762 984 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 TSPYL6Q8N831 410 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 TRIM15Q9C019 465 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 MIS12Q9H081 205 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 DIAPH2O60879 1101 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 GPBP1Q86WP2 473 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 APOA1P02647 267 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 KCNA3P22001 575 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 BTKQ06187 659 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NUDT3-201ENST00000607016 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 ARID5BQ14865 1188 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 KDRP35968 1356 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 BBOF1Q8ND07 529 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 HDAC4P56524 1084 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 COPS6Q7L5N1 327 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 CNGA3Q16281 694 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 NLRP14Q86W24 1093 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 EPC1Q9H2F5 836 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 AZI2Q9H6S1 392 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 GNA14O95837 355 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 KCNA1Q09470 495 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 CLIC4Q9Y696 253 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 ECEL1O95672 775 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 KRT24Q2M2I5 525 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 ARMT1Q9H993 441 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 GUCY1A3Q02108 690 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 RFX6Q8HWS3 928 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.64□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 ST5P78524 1137 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 PRDM1O75626 825 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 TPH2Q8IWU9 490 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 NEK9Q8TD19 979 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 THAP11Q96EK4 314 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 EHD2Q9NZN4 543 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 CEP78Q5JTW2 689 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 TTC17Q96AE7 1141 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 JDP2Q8WYK2 163 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 COG4Q9H9E3 785 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 SPDYE6P0CI01 402 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 DR1Q01658 176 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 EXT2Q93063 718 aa14.63□□□□□ -0.07
NUDT3-201ENST00000607016 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms