RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 RGS22Q8NE09 1264 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 VWCEQ96DN2 955 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 B4DLN1 442 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 COPS5Q92905 334 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 KAT14Q9H8E8 782 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 ABCB11O95342 1321 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 A6NJR5 290 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 B4E1Z4 1266 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 KPNA6O60684 536 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 ANKS1AQ92625 1134 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 HIP1O00291 1037 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PFKMP08237 780 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 TTLL4Q14679 1199 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 MAF1Q9H063 256 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ZBBXA8MT70 800 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ARIH2O95376 493 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 RABGGTBP53611 331 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ADGRE1Q14246 886 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 MUC3AQ02505 3323 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PPM1EQ8WY54 764 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 TBC1D5Q92609 795 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 COL20A1Q9P218 1284 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PITPNM1O00562 1244 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 RFC2P35250 354 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 KRT23Q9C075 422 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 PTPRSQ13332 1948 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 MMP3P08254 477 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 MYOGP15173 224 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 IGFBP4P22692 258 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 FBXO11Q86XK2 927 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 TET1Q8NFU7 2136 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 AFG1LQ8WV93 481 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 IWS1Q96ST2 819 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 RMDN3Q96TC7 470 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 REV3LO60673 3130 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 TTC28Q96AY4 2481 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 GH1P01241 217 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 IQCF3P0C7M6 154 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ACTN1P12814 892 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGAP1Q07960 439 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 STXBP2Q15833 593 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 LY6KQ17RY6 165 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 RETREG2Q8NC44 543 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 IL25Q9H293 177 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 NOD1Q9Y239 953 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAF4-216ENST00000586813 CHMP4BP1P59074 171 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 BFSP2Q13515 415 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 THEGQ9P2T0 379 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 TRANK1O15050 2925 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 SESTD1Q86VW0 696 aa22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms