RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	AIFM3	Q96NN9	605 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	JAK2	O60674	1132 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	C6orf50	Q9HD87	102 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CYBA	P13498	195 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	FOSB	P53539	338 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	GHRHR	Q02643	423 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	WASF1	Q92558	559 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	PXMP2	Q9NR77	195 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	MEIS2	O14770	477 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP5	P59047	1200 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	TRPV1	Q8NER1	839 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	TMX3	Q96JJ7	454 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	PIK3CD	O00329	1044 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	XBP1	P17861	261 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	ACVR2B	Q13705	512 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB118	Q96PH6	123 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	ALG1	Q9BT22	464 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	CAPN15	O75808	1086 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	IGHA2	P01877	340 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	GNA11	P29992	359 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	SOX10	P56693	466 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	ANO1	Q5XXA6	986 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	PGBD1	Q96JS3	809 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	ESYT2	A0FGR8	921 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	PGM5	Q15124	567 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	STXBP2	Q15833	593 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	BICD2	Q8TD16	824 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	IWS1	Q96ST2	819 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	VTA1	Q9NP79	307 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM260	Q9NX78	707 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	AKR1A1	P14550	325 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	CCND2	P30279	289 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	SEPT4	O43236	478 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	NR3C2	P08235	984 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	EDNRB	P24530	442 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM29	Q14134	588 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	IL31RA	Q8NI17	732 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	MORC4	Q8TE76	937 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	SHISA4	Q96DD7	197 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	POTEF	A5A3E0	1075 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	GJB1	P08034	283 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	ANO3	Q9BYT9	981 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	MSC	O60682	206 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	AP3B2	Q13367	1082 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	KATNBL1	Q9H079	304 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	RARB	P10826	455 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	HSCB	Q8IWL3	235 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTS3	O15072	1205 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
GPS1-223	ENST00000584229	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	SGPL1	O95470	568 aa		28.51	■■■□□ 2.15

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