RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 MORC4Q8TE76 937 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 NEK1Q96PY6 1258 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 RMDN3Q96TC7 470 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 MTA3Q9BTC8 594 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 MAF1Q9H063 256 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 LY9Q9HBG7 655 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 Q9Y3F1 56 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 ELP1O95163 1332 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 DDAH1O94760 285 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CLTBP09497 229 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CALM1P0DP23 149 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CALM2P0DP24 149 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CALM3P0DP25 149 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 RAG1P15918 1043 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 RXRAP19793 462 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PTGS1P23219 599 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 FGD1P98174 961 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 KRT32Q14532 448 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2R5BQ15173 497 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 STXBP2Q15833 593 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 SCFD2Q8WU76 684 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 BADQ92934 168 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CYTH3O43739 400 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CABYRO75952 493 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 MYL3P08590 195 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 POLR2MP0CAP2 368 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 LIFRP42702 1097 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 TTLL4Q14679 1199 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 TDHQ8IZJ6 230 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 MTMR8Q96EF0 704 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 IWS1Q96ST2 819 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 MAP3K14Q99558 947 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 COL20A1Q9P218 1284 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CDH23Q9H251 3354 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 ARVCFO00192 962 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CTAGE5O15320 804 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 NR3C2P08235 984 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 EDNRBP24530 442 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CPT1AP50416 773 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 CHMP4BP1P59074 171 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PSMC6P62333 389 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 NKX3-2P78367 333 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 ITGA7Q13683 1181 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 MICU3Q86XE3 530 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 RASEFQ8IZ41 740 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 FANCBQ8NB91 859 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 COPS5Q92905 334 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 TOX2Q96NM4 488 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PHF12Q96QT6 1004 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PXMP2Q9NR77 195 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-214ENST00000583153 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms