RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 ARHGEF16Q5VV41 709 aa32.57■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 SMPD1P17405 629 aa32.56■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 BMP8BP34820 402 aa32.56■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP32.56■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 KLHDC9Q8NEP7 349 aa32.56■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 LCTP09848 1927 aa32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 CDC27P30260 824 aa32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 GJA9P57773 515 aa32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 LRRC26Q2I0M4 334 aa32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 FERMT2Q96AC1 680 aa32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 IWS1Q96ST2 819 aa32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 PPP2R5BQ15173 497 aa32.54■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 PXMP2Q9NR77 195 aa32.54■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 PHF24Q9UPV7 400 aa32.54■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa32.53■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa32.53■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 MYADML2A6NDP7 307 aa32.53■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 SYN1P17600 705 aa32.53■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 FUT2Q10981 343 aa32.53■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 TMEM63BQ5T3F8 832 aa32.53■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 WDR11Q9BZH6 1224 aa32.53■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 MCM3APO60318 1980 aa32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 ADD1P35611 737 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 STXBP2Q15833 593 aa32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 KCNA10Q16322 511 aa32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 TLK2Q86UE8 772 aa32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 FCHSD1Q86WN1 690 aa32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 LRCH3Q96II8 777 aa32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 AP5M1Q9H0R1 490 aa32.52■■■□□ 2.8
NOMO3-217ENST00000576589 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 PTGS1P23219 599 aa32.51■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 CST5P28325 142 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 ANAPC15P60006 121 aa32.51■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 DUSP28Q4G0W2 176 aa32.51■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 GNASQ5JWF2 1037 aa32.51■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 V9GY48 417 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 SEC24BO95487 1268 aa32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 NR3C2P08235 984 aa32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 NKX3-2P78367 333 aa32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 SCFD2Q8WU76 684 aa32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 CUL5Q93034 780 aa32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 PDRG1Q9NUG6 133 aa32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 Q9Y3F1 56 aa32.5■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 MYH6P13533 1939 aa32.49■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 A0A1W2PQY0 241 aa32.49■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 MOXD2PA6NHM9 499 aa32.49■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 CTAGE5O15320 804 aa32.49■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 ACLYP53396 1101 aa32.49■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 EVCP57679 992 aa32.49■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP32.49■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 PDCD2LQ9BRP1 358 aa32.49■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 LRRC37A2A6NM11 1700 aa32.48■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 BEX3Q00994 111 aa32.48■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L6PQ6QN14 398 aa32.48■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 SEPT14Q6ZU15 432 aa32.48■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa32.48■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 NID2Q14112 1375 aa32.47■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 PSTPIP2Q9H939 334 aa32.47■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 PIK3CDO00329 1044 aa32.46■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 MEIS2O14770 477 aa32.46■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 ASGR1P07306 291 aa32.46■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 RTP1P59025 263 aa32.46■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 TTLL4Q14679 1199 aa32.46■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 PGM5Q15124 567 aa32.46■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 WWC2Q6AWC2 1192 aa32.46■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP32.45■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 TXNP10599 105 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 VSIG10LQ86VR7 867 aa32.45■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 STARD7Q9NQZ5 370 aa32.45■■■□□ 2.79
NOMO3-217ENST00000576589 CCT2P78371 535 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
NOMO3-217ENST00000576589 SNX17Q15036 470 aa32.44■■■□□ 2.78
NOMO3-217ENST00000576589 OR6J1Q8NGC5 347 aa32.44■■■□□ 2.78
NOMO3-217ENST00000576589 IL31RAQ8NI17 732 aa32.44■■■□□ 2.78
NOMO3-217ENST00000576589 GLT1D1Q96MS3 346 aa32.44■■■□□ 2.78
NOMO3-217ENST00000576589 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms