RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567087.5

PKM-218, Transcript of pyruvate kinase M1/2, humanhuman

TSL 4

Gene PKM, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKM-218ENST00000567087 HSD17B4P51659 736 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 KRT32Q14532 448 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 TTLL4Q14679 1199 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 NEK1Q96PY6 1258 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 COL20A1Q9P218 1284 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 MYH6P13533 1939 aa21.48■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 ARVCFO00192 962 aa21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 CYTH3O43739 400 aa21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 PTGS1P23219 599 aa21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 GHRHRQ02643 423 aa21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 STXBP2Q15833 593 aa21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.47■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 OPLAHO14841 1288 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 KIAA0355O15063 1070 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 POLR2MP0CAP2 368 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 RAG1P15918 1043 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 BADQ92934 168 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 PXMP2Q9NR77 195 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.46■■□□□ 1.03
PKM-218ENST00000567087 SMARCA1P28370 1054 aa21.45■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 FAAP100Q0VG06 881 aa21.45■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 LTBP2Q14767 1821 aa21.45■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 CDK7P50613 346 aa21.44■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 ITGA7Q13683 1181 aa21.44■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.44■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.44■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.44■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 REC8O95072 547 aa21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 NR3C2P08235 984 aa21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 MYL3P08590 195 aa21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 RXRAP19793 462 aa21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 MICU3Q86XE3 530 aa21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.43■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 KPNA6O60684 536 aa21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 RASEFQ8IZ41 740 aa21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 COPS5Q92905 334 aa21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 CUL5Q93034 780 aa21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 TBX21Q9UL17 535 aa21.42■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 ARIH2O95376 493 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 GH1P01241 217 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 FGD1P98174 961 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 FPGSQ05932 587 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 FANCBQ8NB91 859 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 LRCH3Q96II8 777 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.41■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 TIMP1P01033 207 aa21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 CCND2P30279 289 aa21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 PSMC6P62333 389 aa21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PKM-218ENST00000567087 A6NJR5 290 aa21.39■■□□□ 1.01
PKM-218ENST00000567087 ITGB8P26012 769 aa21.39■■□□□ 1.01
PKM-218ENST00000567087 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PKM-218ENST00000567087 PGM5Q15124 567 aa21.39■■□□□ 1.01
PKM-218ENST00000567087 LY6KQ17RY6 165 aa21.39■■□□□ 1.01
PKM-218ENST00000567087 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.39■■□□□ 1.01
PKM-218ENST00000567087 APOA5Q6Q788 366 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms