RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 TRAF1Q13077 416 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 WASF1Q92558 559 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 TINF2Q9BSI4 451 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 BTBD18B2RXH4 712 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 INHAP05111 366 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 IRF5Q13568 498 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 MTFR1Q15390 333 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 PIK3CDO00329 1044 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 BLIDQ8IZY5 108 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 TRPV1Q8NER1 839 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 IL27Q8NEV9 243 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 GHRHRQ02643 423 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 PGM5Q15124 567 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 ANO3Q9BYT9 981 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 ESYT2A0FGR8 921 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 KIF28PB7ZC32 967 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 MMP1P03956 469 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 GNA11P29992 359 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM29Q14134 588 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 SORBS3O60504 671 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 XBP1P17861 261 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-212ENST00000561293 M0R2N6 131 aa24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 NR3C2P08235 984 aa24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 HMGCRP04035 888 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 CNGA1P29973 690 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 PDE4DQ08499 809 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 PKP1Q13835 747 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ADCY6O43306 1168 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 IGHA2P01877 340 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 MCTP1Q6DN14 999 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 EDIL3O43854 480 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 KRT2P35908 639 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 INF2Q27J81 1249 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 FERMT3Q86UX7 667 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 DNERQ8NFT8 737 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 WNT7AO00755 349 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 RGS20O76081 388 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 PRMT2P55345 433 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 KATNBL1Q9H079 304 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 RPTORQ8N122 1335 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 H3BQV1 296 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ATP2B1P20020 1258 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 SYT1P21579 422 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 EDNRBP24530 442 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 IFFO2Q5TF58 517 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 TBCKQ8TEA7 893 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ASB14A6NK59 587 aa24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms