RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.71■■□□□ 1.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNKSO95271 1327 aa22.71■■□□□ 1.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAD50Q92878 1312 aa22.71■■□□□ 1.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A6NJR5 290 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PFKMP08237 780 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IQCA1Q86XH1 822 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKS1AQ92625 1134 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCLYQ96I15 445 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.7■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC28Q96AY4 2481 aa22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEDD4P46934 1319 aa22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP2C9P11712 490 aa22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SKAP1Q86WV1 359 aa22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VWCEQ96DN2 955 aa22.69■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTLL4Q14679 1199 aa22.68■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USH1GQ495M9 461 aa22.68■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PNMA1Q8ND90 353 aa22.68■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDM4AO75164 1064 aa22.67■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRE1Q14246 886 aa22.67■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.67■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPM1EQ8WY54 764 aa22.67■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COPS5Q92905 334 aa22.67■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPVLQ9H3G5 476 aa22.67■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KAT14Q9H8E8 782 aa22.67■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.67■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYO9BQ13459 2157 aa22.67■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCB11O95342 1321 aa22.66■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBBXA8MT70 800 aa22.66■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RFC2P35250 354 aa22.66■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.66■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGFBP4P22692 258 aa22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RABGGTBP53611 331 aa22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RETREG2Q8NC44 543 aa22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBC1D5Q92609 795 aa22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.65■■□□□ 1.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PITPNM1O00562 1244 aa22.64■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACTN1P12814 892 aa22.64■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.64■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IWS1Q96ST2 819 aa22.64■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.64■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.64■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B4E1Z4 1266 aa22.63■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARIH2O95376 493 aa22.63■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IQCF3P0C7M6 154 aa22.63■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BFSP2Q13515 415 aa22.63■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.63■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.63■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYOGP15173 224 aa22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STXBP2Q15833 593 aa22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AFG1LQ8WV93 481 aa22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RMDN3Q96TC7 470 aa22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT23Q9C075 422 aa22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THEGQ9P2T0 379 aa22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOD1Q9Y239 953 aa22.62■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MUC3AQ02505 3323 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GH1P01241 217 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO11Q86XK2 927 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASB2Q96Q27 587 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL20A1Q9P218 1284 aa22.61■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LY6KQ17RY6 165 aa22.6■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.6■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRANK1O15050 2925 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms