RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 RNF208Q9H0X6 261 aa20.53■□□□□ 0.88
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BRF1-209ENST00000547052 CCND2P30279 289 aa20.52■□□□□ 0.88
BRF1-209ENST00000547052 CYP2C19P33261 490 aa20.52■□□□□ 0.88
BRF1-209ENST00000547052 AP3B2Q13367 1082 aa20.52■□□□□ 0.88
BRF1-209ENST00000547052 STXBP2Q15833 593 aa20.52■□□□□ 0.88
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BRF1-209ENST00000547052 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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BRF1-209ENST00000547052 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 PKN1Q16512 942 aa20.5■□□□□ 0.87
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BRF1-209ENST00000547052 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
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BRF1-209ENST00000547052 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 AKR1A1P14550 325 aa20.49■□□□□ 0.87
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BRF1-209ENST00000547052 SPC25Q9HBM1 224 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 OPLAHO14841 1288 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 RARBP10826 455 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 CYBAP13498 195 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 MEIS2O14770 477 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 SEPT4O43236 478 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 NR3C2P08235 984 aa20.47■□□□□ 0.87
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BRF1-209ENST00000547052 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 MORC4Q8TE76 937 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 SNX21Q969T3 373 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 C8orf76Q96K31 380 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 JAK2O60674 1132 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 CTDNEP1O95476 244 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 ZNF76P36508 570 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 TTLL4Q14679 1199 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 PGM5Q15124 567 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 NLRX1Q86UT6 975 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 SCFD2Q8WU76 684 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 FGD4Q96M96 766 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 ANO3Q9BYT9 981 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 COL20A1Q9P218 1284 aa20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
BRF1-209ENST00000547052 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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BRF1-209ENST00000547052 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 KRT2P35908 639 aa20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 TRIM32Q13049 653 aa20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 BECN1Q14457 450 aa20.45■□□□□ 0.86
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BRF1-209ENST00000547052 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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BRF1-209ENST00000547052 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 BLIDQ8IZY5 108 aa20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 CDHR1Q96JP9 859 aa20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 DEFB118Q96PH6 123 aa20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 EDNRBP24530 442 aa20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.44■□□□□ 0.86
BRF1-209ENST00000547052 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.43■□□□□ 0.86
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