RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	SELP	P16109	830 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	GNAT2	P19087	354 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDE4B	Q07343	736 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	IKBKE	Q14164	716 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	ICAM1	P05362	532 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	RLBP1	P12271	317 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDE4D	Q08499	809 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	SNAP25	P60880	206 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	DEFB103A	P81534	67 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	TFAP4	Q01664	338 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	CXCL10	P02778	98 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	NCK2	O43639	380 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	ST18	O60284	1047 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	CALML3	P27482	149 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZP2	Q05996	745 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	APPBP2	Q92624	585 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRRX2	Q99811	253 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TXNRD1-223	ENST00000531691	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	NBN	O60934	754 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	AMH	P03971	560 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	CKB	P12277	381 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	RBL2	Q08999	1139 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPNMB	Q14956	572 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	PKN1	Q16512	942 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	NFIB	O00712	420 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPAA1	O43292	621 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	MS4A1	P11836	297 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	PTPN5	P54829	565 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	COPS5	Q92905	334 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	LGR5	O75473	907 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	FOXK2	Q01167	660 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	PTK7	Q13308	1070 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPM6B	Q13491	265 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TXNRD1-223	ENST00000531691	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.18	□□□□□ -0.3

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