RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	OXER1	Q8TDS5	423 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	WASF1	Q92558	559 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	TINF2	Q9BSI4	451 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	C6orf50	Q9HD87	102 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ESYT2	A0FGR8	921 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ASB14	A6NK59	587 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	IGHA2	P01877	340 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CYBA	P13498	195 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PTGS1	P23219	599 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CNGA1	P29973	690 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PDE4D	Q08499	809 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PGM5	Q15124	567 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ANO1	Q5XXA6	986 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	KRT40	Q6A162	431 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	TNS4	Q8IZW8	715 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	DNER	Q8NFT8	737 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF333	Q96JL9	665 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ANO3	Q9BYT9	981 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	NR3C2	P08235	984 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CCL5	P13501	91 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	XBP1	P17861	261 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	EDNRB	P24530	442 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	GNA11	P29992	359 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ARMC5	Q96C12	935 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ABHD8	Q96I13	439 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	C8orf76	Q96K31	380 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	KATNBL1	Q9H079	304 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	ADCY6	O43306	1168 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	MMP1	P03956	469 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	NR5A1	Q13285	461 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	ACVR2B	Q13705	512 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	TRIM29	Q14134	588 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	MAF1	Q9H063	256 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	BTBD18	B2RXH4	712 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978		M0R2N6	131 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	SORBS3	O60504	671 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	RGS20	O76081	388 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	CCND2	P30279	289 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	KRT2	P35908	639 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	AP3B2	Q13367	1082 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	STXBP2	Q15833	593 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		10.38	□□□□□ -0.75

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