RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 HPSEQ9Y251 543 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GAKO14976 1311 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 STXBP3O00186 592 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 DPEP1P16444 411 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8FQ08AF8 430 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC174Q6PII3 467 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 COL4A1P02462 1669 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 F5H6K3 240 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CPP00450 1065 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 IVLP07476 585 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PAX3P23760 479 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 KLRC3Q07444 240 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CPXCR1Q8N123 301 aa8.74□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 MYBL2P10244 700 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 CUL4BQ13620 913 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GSDMAQ96QA5 445 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 RMI1Q9H9A7 625 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ST7Q9NRC1 585 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ECEL1O95672 775 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PAK1Q13153 545 aa8.73□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 DACT2Q5SW24 774 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SV2BQ7L1I2 683 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO11Q86XK2 927 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.73□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PIM2Q9P1W9 311 aa8.73□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PRR16Q569H4 304 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SARM1Q6SZW1 724 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 POTEDQ86YR6 584 aa8.72□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 POTEMA6NI47 508 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB5O15062 677 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 BMP3P12645 472 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MNAT1P51948 309 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF280DQ6N043 979 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 AMNQ9BXJ7 453 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GDAQ9Y2T3 454 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 EPS15P42566 896 aa8.72□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 CEP135Q66GS9 1140 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTS3O15072 1205 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CHMP2AO43633 222 aa8.71□□□□□ -1.01
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