RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 LMNB1P20700 586 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 USP8P40818 1118 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GBP6Q6ZN66 633 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CBX8Q9HC52 389 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 M0QZ92 97 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 STXBP3O00186 592 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ASAP2O43150 1006 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GNAT1P11488 350 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.386e-6■■■■□ 21.9
POLK-215ENST00000514141 ZNF543Q08ER8 600 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MTMR3Q13615 1198 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 EPHA7Q15375 998 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.46□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SLC26A2P50443 739 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 LMNB2Q03252 620 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CAMK4Q16566 473 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZNF592Q92610 1267 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MKL1Q969V6 931 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 BICD1Q96G01 975 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KAZALD1Q96I82 304 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TJP1Q07157 1748 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KPNA6O60684 536 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SRGNP10124 158 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TM4SF1P30408 202 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 UBXN1Q04323 297 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KCTD2Q14681 263 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ASIC2Q16515 512 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 LONRF3Q496Y0 759 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 P2RX5Q93086 422 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 FNBP1Q96RU3 617 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ANO3Q9BYT9 981 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 DISC1Q9NRI5 854 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 FLT1P17948 1338 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ACTN2P35609 894 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RFC5P40937 340 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZNF174Q15697 407 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NELFBQ8WX92 580 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MTMR7Q9Y216 660 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ATP8B3O60423 1300 aa6.45□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NHSQ6T4R5 1651 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZNF233A6NK53 670 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 WDR64B1ANS9 1081 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 EFNA5P52803 228 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GPRASP2Q96D09 838 aa6.44□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KIF2CQ99661 725 aa6.44□□□□□ -1.38
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