RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 MFSD5Q6N075 450 aa13.15□□□□□ -0.3
UBE2B-208ENST00000511807 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.15□□□□□ -0.3
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UBE2B-208ENST00000511807 CATIPQ7Z7H3 387 aa13.15□□□□□ -0.3
UBE2B-208ENST00000511807 TLK2Q86UE8 772 aa13.15□□□□□ -0.3
UBE2B-208ENST00000511807 HSCBQ8IWL3 235 aa13.15□□□□□ -0.3
UBE2B-208ENST00000511807 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
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UBE2B-208ENST00000511807 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
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UBE2B-208ENST00000511807 TMEM199Q8N511 208 aa13.14□□□□□ -0.31
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UBE2B-208ENST00000511807 ASTN1O14525 1302 aa13.13□□□□□ -0.31
UBE2B-208ENST00000511807 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.13□□□□□ -0.31
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UBE2B-208ENST00000511807 TIFAQ96CG3 184 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2B-208ENST00000511807 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
UBE2B-208ENST00000511807 SENP2Q9HC62 589 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2B-208ENST00000511807 VTA1Q9NP79 307 aa13.11□□□□□ -0.31
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA8BA8MQT2 603 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2B-208ENST00000511807 GRXCR1A8MXD5 290 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2B-208ENST00000511807 PFKFB2O60825 505 aa13.1□□□□□ -0.31
UBE2B-208ENST00000511807 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
UBE2B-208ENST00000511807 CD4P01730 458 aa13.1□□□□□ -0.31
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