RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503062.1

ADD1-208, Transcript of adducin 1, human

TSL 2

Gene ADD1, Length 488 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-208	ENST00000503062	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062		F5H6K3	240 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	KLRC3	Q07444	240 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	HYAL1	Q12794	435 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	RAD50	Q92878	1312 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	KPNA6	O60684	536 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	AMH	P03971	560 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ADD1-208	ENST00000503062	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	CKB	P12277	381 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	PDE6A	P16499	860 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	ACACB	O00763	2458 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	LCT	P09848	1927 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	LINC01565	O15544	149 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	NDUFV1	P49821	464 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	RBL2	Q08999	1139 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	ZNF292	O60281	2723 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	PRKAB2	O43741	272 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	CSPG5	O95196	566 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	EYA4	O95677	639 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	GNAI2	P04899	355 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	ALAS1	P13196	640 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062		A6NJR5	290 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	LGR5	O75473	907 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	FDX1	P10109	184 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	CTNNB1	P35222	781 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	GRM6	O15303	877 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	UPP2	O95045	317 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	ICAM3	P32942	547 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	ADAM15	Q13444	863 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ADD1-208	ENST00000503062	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.29	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms