RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491264.5

HOXB-AS3-213, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 478 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SCFD2Q8WU76 684 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 COL20A1Q9P218 1284 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 Q9Y3F1 56 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MYADML2A6NDP7 307 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CPA1P15085 419 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SYN1P17600 705 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 Q6ZUG5 572 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CUL5Q93034 780 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PXMP2Q9NR77 195 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LCTP09848 1927 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 OPLAHO14841 1288 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ASGR1P07306 291 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RPS6KB1P23443 525 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GHRHRQ02643 423 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TTLL4Q14679 1199 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP26Q9BXU7 913 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RCAN1P53805 252 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 BEX3Q00994 111 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TRIM60Q495X7 471 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 BRF1Q92994 677 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NR3C2P08235 984 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SNX17Q15036 470 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ELP1O95163 1332 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ALPK3Q96L96 1907 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CABYRO75952 493 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CPT1AP50416 773 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NKX3-2P78367 333 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 APOBRQ0VD83 1088 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCND2P30279 289 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RUFY3Q7L099 469 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TLE2Q04725 743 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CTAGE5O15320 804 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PTGS1P23219 599 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PGM5Q15124 567 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FBXL16Q8N461 479 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PIK3CDO00329 1044 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GH1P01241 217 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MYL3P08590 195 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CLTBP09497 229 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NAPAP54920 295 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARVCFO00192 962 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms