RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 NPHS1O60500 1241 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 PLATP00750 562 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF394Q53GI3 561 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 MATN3O15232 486 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 NTRK1P04629 796 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 SLC7A5Q01650 507 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 GRB10Q13322 594 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 RGL3Q3MIN7 710 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 FAM124AQ86V42 546 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 LGI4Q8N135 537 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 FGD4Q96M96 766 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 C8orf49Q96NF6 230 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 C7orf72A4D263 438 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 FUCA1P04066 466 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 EPHX1P07099 455 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 C8BP07358 591 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF20P17024 532 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 THBS2P35442 1172 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 BORAQ6PGQ7 559 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 FANCCQ00597 558 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 KYQ8NBH2 561 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 CHST13Q8NET6 341 aa7.43□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 BACH2Q9BYV9 841 aa7.43□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 SRRDQ9UH36 339 aa7.43□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 INVSQ9Y283 1065 aa7.43□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 MROH6A6NGR9 719 aa7.42□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 TTLL6Q8N841 843 aa7.42□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.42□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 SPATA32Q96LK8 384 aa7.42□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF536O15090 1300 aa7.42□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 GINM1Q9NU53 330 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1W2PQH9 124 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 FSHBP01225 129 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 GIPRP48546 466 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 MCTP2Q6DN12 878 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 MIB1Q86YT6 1006 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 MMP19Q99542 508 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 SYT3Q9BQG1 590 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 CLEC1BQ9P126 229 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA4-211ENST00000490435 PLS3P13797 630 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 SOX9P48436 509 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 SEC14L1Q92503 715 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 AKT3Q9Y243 479 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 SGSM2O43147 1006 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 SUV39H1O43463 412 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 DPF3Q92784 378 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 COPS5Q92905 334 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 ITGA1P56199 1179 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 PAK2Q13177 524 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 SURF1Q15526 300 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 MBLAC2Q68D91 279 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 STK32CQ86UX6 486 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 BTG4Q9NY30 223 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA4-211ENST00000490435 C9orf118A6NHY6 69 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms