RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.85■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COL20A1Q9P218 1284 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q9Y3F1 56 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYADML2A6NDP7 307 aa22.84■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CPA1P15085 419 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SYN1P17600 705 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q6ZUG5 572 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CUL5Q93034 780 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PXMP2Q9NR77 195 aa22.84■■□□□ 1.25
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 GHRHRQ02643 423 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTLL4Q14679 1199 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP26Q9BXU7 913 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.82■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RCAN1P53805 252 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BEX3Q00994 111 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRIM60Q495X7 471 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BRF1Q92994 677 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NR3C2P08235 984 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SNX17Q15036 470 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ELP1O95163 1332 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ALPK3Q96L96 1907 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 CPT1AP50416 773 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NKX3-2P78367 333 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.79■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCND2P30279 289 aa22.79■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 TLE2Q04725 743 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CTAGE5O15320 804 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PTGS1P23219 599 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PGM5Q15124 567 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.77■■□□□ 1.24
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PIK3CDO00329 1044 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GH1P01241 217 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYL3P08590 195 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CLTBP09497 229 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NAPAP54920 295 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARVCFO00192 962 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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