RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 HOXC6P09630 235 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 SYT1P21579 422 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 GRK4P32298 578 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLK2P49760 499 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 FLT3LGP49771 235 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 NPY5RQ15761 445 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 USP17L6PQ6QN14 398 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 DPP9Q86TI2 863 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM133AQ8N9E0 248 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 APBA2Q99767 749 aa13.09□□□□□ -0.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 M0R2N6 131 aa13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRT25Q7Z3Z0 450 aa13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 USP6NLQ92738 828 aa13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 GJB4Q9NTQ9 266 aa13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 GJD2Q9UKL4 321 aa13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PCDHA6Q9UN73 950 aa13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 FRMPD4Q14CM0 1322 aa13.08□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 CENPFP49454 3210 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ASB14A6NK59 587 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ADCY3O60266 1144 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PGK2P07205 417 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 FOSBP53539 338 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 GUCY1B3Q02153 619 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 IRF5Q13568 498 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 MTFR1Q15390 333 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBE2SQ16763 222 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF792Q3KQV3 632 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 XRRA1Q6P2D8 792 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 FCHSD1Q86WN1 690 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TBC1D5Q92609 795 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 IWS1Q96ST2 819 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 RMDN3Q96TC7 470 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ANO3Q9BYT9 981 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPTORQ8N122 1335 aa13.07□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 BTBD18B2RXH4 712 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 COBLO75128 1261 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ELNP15502 786 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 SREBF1P36956 1147 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ARHGEF16Q5VV41 709 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 OLFML2BQ68BL8 750 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 MCTP1Q6DN14 999 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 BRAPQ7Z569 592 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 NOSTRINQ8IVI9 506 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TNFRSF25Q93038 417 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PXMP2Q9NR77 195 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 COL20A1Q9P218 1284 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 MTMR6Q9Y217 621 aa13.06□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCTP09848 1927 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 STAM2O75886 525 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRAPPC10P48553 1259 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 NUCB2P80303 420 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 CNTN2Q02246 1040 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 NR5A1Q13285 461 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 RASGRP4Q8TDF6 673 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 OXER1Q8TDS5 423 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 MAML3Q96JK9 1138 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAAR1Q96RJ0 339 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PDCD2LQ9BRP1 358 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 CYP3A4P08684 503 aa13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 CYP2B6P20813 491 aa13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 EDNRBP24530 442 aa13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCND2P30279 289 aa13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 DDIT3P35638 169 aa13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 USP11P51784 963 aa13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBXN2AP68543 259 aa13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PGM5Q15124 567 aa13.04□□□□□ -0.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PCNX4Q63HM2 1172 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms