RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468583.1

STX4-206, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 5

Gene STX4, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-206ENST00000468583 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.5■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 MEIS2O14770 477 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 GNA11P29992 359 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 PDE4DQ08499 809 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 MTFR1Q15390 333 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 BICD2Q8TD16 824 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 MORC4Q8TE76 937 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 TMX3Q96JJ7 454 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 TAAR1Q96RJ0 339 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 IWS1Q96ST2 819 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 RNF208Q9H0X6 261 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 PXMP2Q9NR77 195 aa15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 MCM3APO60318 1980 aa15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 CCDC85CA6NKD9 419 aa15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 JAK2O60674 1132 aa15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 EDNRBP24530 442 aa15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 AP3B2Q13367 1082 aa15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 UBE2SQ16763 222 aa15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 VTA1Q9NP79 307 aa15.48■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 SEPT4O43236 478 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 MSCO60682 206 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 CNGA1P29973 690 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 NLRP5P59047 1200 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 ACVR2BQ13705 512 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 MCTP2Q6DN12 878 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 GALNT17Q6IS24 598 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 AIFM3Q96NN9 605 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 ALG1Q9BT22 464 aa15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 NR3C2P08235 984 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 AKR1A1P14550 325 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 CCND2P30279 289 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 TRIM29Q14134 588 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 PGM5Q15124 567 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 STXBP2Q15833 593 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 TRPV1Q8NER1 839 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 KATNBL1Q9H079 304 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 KIF3AQ9Y496 699 aa15.46■□□□□ 0.07
STX4-206ENST00000468583 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 GJB1P08034 283 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 HSCBQ8IWL3 235 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 DAGLBQ8NCG7 672 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 SNX21Q969T3 373 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 SHISA4Q96DD7 197 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 DEFB118Q96PH6 123 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 ANO3Q9BYT9 981 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 FAM184BQ9ULE4 1060 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 DTNBO60941 627 aa15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 STAM2O75886 525 aa15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 CAPN2P17655 700 aa15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 IL31RAQ8NI17 732 aa15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.44■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 RARBP10826 455 aa15.43■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 GJA8P48165 433 aa15.43■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.43■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 GNPTABQ3T906 1256 aa15.43■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.43■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.43■□□□□ 0.06
STX4-206ENST00000468583 BLIDQ8IZY5 108 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms