RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394022.7

RALGPS1-207, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-207ENST00000394022 AMPD3Q01432 767 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 FANCLQ9NW38 375 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 RNF181Q9P0P0 153 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.39■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CFBP00751 764 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 Q4G0T1 1027 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 LDHDQ86WU2 507 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 WDR18Q9BV38 432 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SERPINC1P01008 464 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PTGS1P23219 599 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 GRB10Q13322 594 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 MTMR2Q13614 643 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 KCNB1Q14721 858 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 TBX3O15119 743 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SLC26A4O43511 780 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ICAM1P05362 532 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CYP3A4P08684 503 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CIITAP33076 1130 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 LRRC15Q8TF66 581 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SYT17Q9BSW7 474 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ATP1A3P13637 1013 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ZNF76P36508 570 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PRR16Q569H4 304 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PNMA5Q96PV4 448 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SPATA1Q5VX52 437 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SV2BQ7L1I2 683 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PTPRAP18433 802 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 VCAM1P19320 739 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 UBASH3AP57075 661 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SPP2Q13103 211 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PNMA2Q9UL42 364 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 KLRC4O43908 158 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 FLOT1O75955 427 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 BACE1P56817 501 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 FAM20AQ96MK3 541 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 TRIM9Q9C026 710 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.34■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 RHOBTB3O94955 611 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ZNF18P17022 549 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 ASIC1P78348 528 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 RAD54LQ92698 747 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 GJA10Q969M2 543 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 KLRG1Q96E93 195 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 STK24Q9Y6E0 443 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-207ENST00000394022 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-207ENST00000394022 FAM86B1E9PN63 330 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-207ENST00000394022 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-207ENST00000394022 FDX1P10109 184 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-207ENST00000394022 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-207ENST00000394022 PAK1Q13153 545 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-207ENST00000394022 STIM1Q13586 685 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-207ENST00000394022 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms