RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GUCY2CP25092 1073 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SLC16A2P36021 539 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SMC6Q96SB8 1091 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TMEM51Q9NW97 253 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.085e-6■□□□□ 9.5
PTPRK-204ENST00000368210 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SCARF1Q14162 830 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 WHAMMQ8TF30 809 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 COA7Q96BR5 231 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 MYL1P05976 194 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GNPTABQ3T906 1256 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 P2RX5Q93086 422 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CDK8P49336 464 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ALX1Q15699 326 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PTPN21Q16825 1174 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GINS2Q9Y248 185 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SLMAPQ14BN4 828 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 COL15A1P39059 1388 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PTPREP23469 700 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ALDH3A1P30838 453 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 DCAF15Q66K64 600 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PIK3C2BO00750 1634 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CLRN2A0PK11 232 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GRM1Q13255 1194 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GJA10Q969M2 543 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 STK17AQ9UEE5 414 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 BCS1LQ9Y276 419 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 STK36Q9NRP7 1315 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TNNI1P19237 187 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RASIP1Q5U651 963 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 RABGGTAQ92696 567 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 MTA3Q9BTC8 594 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 XKR9Q5GH70 373 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 E7EVH7 732 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ATP1A3P13637 1013 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 ABCB4P21439 1286 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 PAGE5Q96GU1 130 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 IQGAP1P46940 1657 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRK-204ENST00000368210 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 K7ENM7 598 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 CYP2D6P10635 497 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 RBL2Q08999 1139 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 LY9Q9HBG7 655 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRK-204ENST00000368210 AMFRQ9UKV5 643 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms