RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317221.11

ZNF559-201, Transcript of zinc finger protein 559, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZNF559, Length 2,732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559-201ENST00000317221 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.34□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SLIT2O94813 1529 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FAM205CA6NFA0 338 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 C5orf60A6NFR6 353 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 B4DLN1 442 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ZPR1O75312 459 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TRIM37O94972 964 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 DEXIO95424 95 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SRGNP10124 158 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 GHRP10912 638 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 LIFRP42702 1097 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FOXO4P98177 505 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SEMA3FQ13275 785 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF174Q15697 407 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 RETREG2Q8NC44 543 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 WHAMMQ8TF30 809 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FBXO41Q8TF61 875 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FERMT2Q96AC1 680 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 KRT12Q99456 494 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TLR10Q9BXR5 811 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PANK4Q9NVE7 773 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 XDHP47989 1333 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 STK36Q9NRP7 1315 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 EYA2O00167 538 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CLSTN1O94985 981 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ZAP70P43403 619 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CDK17Q00537 523 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 RIPK1Q13546 671 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 EXOC1Q9NV70 894 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 RNF14Q9UBS8 474 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 C4AP0C0L4 1744 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 C4BP0C0L5 1744 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 DISP2A7MBM2 1401 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 F8W031 263 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 H0YGN5 161 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 DIAPH2O60879 1101 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 HSD17B3P37058 310 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CASP7P55210 303 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PPP2R2AP63151 447 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TRAF1Q13077 416 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PTGDRQ13258 359 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SCARF1Q14162 830 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ADSSL1Q8N142 457 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC63Q8NA47 563 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 NFS1Q9Y697 457 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 UTRNP46939 3433 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 NBPF26B4DH59 902 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 H7C1W4 665 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 BUB1O43683 1085 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ORC4O43929 436 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 AKR1B10O60218 316 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 MAGEA1P43355 309 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 DNA2P51530 1060 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 BIRC3Q13489 604 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms