RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.6■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 KLRC4O43908 158 aa25.6■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 MYL1P05976 194 aa25.6■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 LMNB1P20700 586 aa25.6■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D5Q92609 795 aa25.6■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.6■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.6■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3CDO00329 1044 aa25.59■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 SREBF1P36956 1147 aa25.59■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 KMT5BQ4FZB7 885 aa25.59■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 TMC6Q7Z403 805 aa25.59■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.59■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.59■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.59■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.59■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 COBLO75128 1261 aa25.59■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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VSTM4-201ENST00000298454 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.59■■□□□ 1.69
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VSTM4-201ENST00000298454 KRT79Q5XKE5 535 aa25.58■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.58■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.58■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.58■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.58■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM9Q9C026 710 aa25.58■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 FZD1Q9UP38 647 aa25.58■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.58■■□□□ 1.69
VSTM4-201ENST00000298454 PRR16Q569H4 304 aa25.58■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 GPC2Q8N158 579 aa25.58■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.58■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.58■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 FAM86B1E9PN63 330 aa25.57■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 CBFA2T2O43439 604 aa25.57■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.57■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 EPS15P42566 896 aa25.57■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 KCNB1Q14721 858 aa25.57■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 PRCPP42785 496 aa25.56■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 ECM1Q16610 540 aa25.56■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN21Q16825 1174 aa25.56■■□□□ 1.68
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VSTM4-201ENST00000298454 C7orf25Q9BPX7 421 aa25.56■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 GINM1Q9NU53 330 aa25.56■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 INTS13Q9NVM9 706 aa25.56■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.56■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 LDHDQ86WU2 507 aa25.56■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 LENG9Q96B70 501 aa25.56■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 GGA3Q9NZ52 723 aa25.56■■□□□ 1.68
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VSTM4-201ENST00000298454 RHOBTB3O94955 611 aa25.55■■□□□ 1.68
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VSTM4-201ENST00000298454 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 Q4G0T1 1027 aa25.55■■□□□ 1.68
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VSTM4-201ENST00000298454 LPAR1Q92633 364 aa25.55■■□□□ 1.68
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VSTM4-201ENST00000298454 MTMR2Q13614 643 aa25.55■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 SV2BQ7L1I2 683 aa25.55■■□□□ 1.68
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VSTM4-201ENST00000298454 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2MP0CAP2 368 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 ASIC1P78348 528 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 AMPD3Q01432 767 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 PAK1Q13153 545 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.54■■□□□ 1.68
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VSTM4-201ENST00000298454 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 CIITAP33076 1130 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 RAD54LQ92698 747 aa25.54■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 WRNIP1Q96S55 665 aa25.54■■□□□ 1.68
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VSTM4-201ENST00000298454 ADSSL1Q8N142 457 aa25.53■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.53■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.53■■□□□ 1.68
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VSTM4-201ENST00000298454 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.52■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.52■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 ABCB11O95342 1321 aa25.52■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 MYMKA6NI61 221 aa25.52■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 CYP3A4P08684 503 aa25.52■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 PDE4DQ08499 809 aa25.52■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 SPP2Q13103 211 aa25.52■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 VSTM4Q8IW00 320 aa25.52■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.52■■□□□ 1.68
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