RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296051.6

HPS3-201, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS3, Length 4,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-201ENST00000296051 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.75□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 POLR2MP0CAP2 368 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 UBXN2AP68543 259 aa14.75□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.75□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.74□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 MED23Q9ULK4 1368 aa14.74□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 SCG2P13521 617 aa14.74□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.74□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 CHP1Q99653 195 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 COA1Q9GZY4 146 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 ADRA2BP18089 450 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 SLC8A3P57103 927 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 NFIXQ14938 502 aa14.74□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 WDR44Q5JSH3 913 aa14.74□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 NFU1Q9UMS0 254 aa14.74□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 UBE3CQ15386 1083 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 VPS72Q15906 364 aa14.73□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 CRB1P82279 1406 aa14.73□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 KCTD1Q719H9 257 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 EFCC1Q9HA90 598 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 UNC13BO14795 1591 aa14.73□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 TBC1D8O95759 1140 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 SLC16A2P36021 539 aa14.73□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 SPOPO43791 374 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 VPS41P49754 854 aa14.72□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 RNF34Q969K3 372 aa14.72□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 TC2NQ8N9U0 490 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 PLVAPQ9BX97 442 aa14.72□□□□□ -0.05
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HPS3-201ENST00000296051 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 TTC26A0AVF1 554 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 PCK1P35558 622 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 GRIN1Q05586 938 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS3-201ENST00000296051 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.72□□□□□ -0.05
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