RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 A6NJR5 290 aa22.92■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 CYP2C9P11712 490 aa22.92■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 SCLYQ96I15 445 aa22.92■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 MAF1Q9H063 256 aa22.92■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.92■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 TTLL4Q14679 1199 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 RAB30Q15771 203 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 IL25Q9H293 177 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 MSRAQ9UJ68 235 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 KPNA6O60684 536 aa22.9■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 ARIH2O95376 493 aa22.9■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO11Q86XK2 927 aa22.9■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.9■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.9■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.9■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 COL20A1Q9P218 1284 aa22.9■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.89■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.89■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 VWCEQ96DN2 955 aa22.89■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.89■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 GBF1Q92538 1859 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 PDE4AP27815 886 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 USP38Q8NB14 1042 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 RMDN3Q96TC7 470 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 MYH6P13533 1939 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 STXBP2Q15833 593 aa22.87■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.87■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 IWS1Q96ST2 819 aa22.87■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.87■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 EYSQ5T1H1 3165 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 ZBBXA8MT70 800 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 PFKMP08237 780 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 CHMP4BP1P59074 171 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 SEC23AQ15436 765 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 LY6KQ17RY6 165 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 TTC22Q5TAA0 569 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 AFG1LQ8WV93 481 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 CDH23Q9H251 3354 aa22.86■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 CFBP00751 764 aa22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 GH1P01241 217 aa22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 RABGGTBP53611 331 aa22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 AMNQ9BXJ7 453 aa22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 KLRF2D3W0D1 207 aa22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 MMP3P08254 477 aa22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP1Q07960 439 aa22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 CHST3Q7LGC8 479 aa22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 RETREG2Q8NC44 543 aa22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 PPM1EQ8WY54 764 aa22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 NOD1Q9Y239 953 aa22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 SCN5AQ14524 2016 aa22.84■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 PITPNM1O00562 1244 aa22.83■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 OPLAHO14841 1288 aa22.83■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 TRDNQ13061 729 aa22.83■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 PXMP2Q9NR77 195 aa22.83■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.83■■□□□ 1.25
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 NR3C2P08235 984 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 IQCF3P0C7M6 154 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 ACTN1P12814 892 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 MYOGP15173 224 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 RFC2P35250 354 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 HSD17B4P51659 736 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 BFSP2Q13515 415 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 ADGRE1Q14246 886 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 MTMR8Q96EF0 704 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.82■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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