RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.94■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 TMEM232C9JQI7 657 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 COG2Q14746 738 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 POSTNQ15063 836 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF592Q92610 1267 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 BTBD19C9JJ37 291 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 IKBKBO14920 756 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 STAT2P52630 851 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.93■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 PDHXO00330 501 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.141e-7■■□□□ 11.5
MSMO1-201ENST00000261507 MYL5Q02045 173 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 MB21D1Q8N884 522 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 TNFRSF25Q93038 417 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 DHX58Q96C10 678 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 MED15Q96RN5 788 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 AOC2O75106 756 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 AFMP43652 599 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 TRAF1Q13077 416 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 STAMQ92783 540 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.92■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 CA12O43570 354 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 FLOT1O75955 427 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 TREML2Q5T2D2 321 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 LBX2Q6XYB7 198 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.143e-11■■■□□ 17
MSMO1-201ENST00000261507 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 SERPINC1P01008 464 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 XBP1P17861 261 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 DSG3P32926 999 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 UBASH3AP57075 661 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 TPM4P67936 248 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 HTRA3P83110 453 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.91■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 PARP14Q460N5 1801 aa15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 KLRF2D3W0D1 207 aa15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 ZBED4O75132 1171 aa15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 PTPN18Q99952 460 aa15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 INTS13Q9NVM9 706 aa15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.9■□□□□ 0.14
MSMO1-201ENST00000261507 NEMFO60524 1076 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 NLRP5P59047 1200 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 PTGDRQ13258 359 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 IL17AQ16552 155 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 KCTD1Q719H9 257 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 CPVLQ9H3G5 476 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 SCG2P13521 617 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 COPB2P35606 906 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 MORC3Q14149 939 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 TTC38Q5R3I4 469 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 SMARCE1Q969G3 411 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.89■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 COBLO75128 1261 aa15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 OAZ1P54368 228 aa15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 GSDMDP57764 484 aa15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 CEP135Q66GS9 1140 aa15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 MCM7P33993 719 aa15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 HERVK_113P62684 666 aa15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
MSMO1-201ENST00000261507 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms