RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Syt5Q9R0N5 386 aa15.58■□□□□ 0.09
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igfbp4P47879 254 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pcif1P59114 706 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Evi5P97366 809 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pbxip1Q3TVI8 727 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Arhgef16Q3U5C8 713 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tpd52Q62393 224 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zbtb7bQ64321 544 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fgd4Q91ZT5 766 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trim11Q99PQ2 467 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cd274Q9EP73 290 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Itgb7P26011 806 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ube2hP62257 183 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kcna2P63141 499 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Taf1bP97358 586 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gpd2Q64521 727 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 IqcgQ80W32 419 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 H2-Q4Q8HWB2 354 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Extl2Q9ES89 330 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plcb2A3KGF7 1181 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10134F6ZQC6 126 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nploc4P60670 608 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fdxacb1Q3UY23 622 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Bbs9Q811G0 885 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rusc1Q8BG26 893 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lrrd1Q8C0R9 853 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccer1Q9CQL2 403 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Leng1Q9DB98 261 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hic1Q9R1Y5 733 aa15.56■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Stra6O70491 670 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pik3r1P26450 724 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trappc3lQ4KL14 181 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Miga1Q4QQM5 600 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr119Q7TRJ5 321 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mcph1Q7TT79 822 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nipa1Q8BHK1 323 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Iws1Q8C1D8 766 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Bcas3Q8CCN5 928 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kcnv2Q8CFS6 562 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mettl5Q8K1A0 209 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Krt23Q99PS0 422 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adgrf4Q9D2L6 698 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Calml3Q9D6P8 149 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mxra8Q9DBV4 442 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Astn1Q61137 1302 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa15.55■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Prom1O54990 867 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Atp9aO70228 1047 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Erbb2P70424 1256 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kiaa1468Q148V7 1216 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sun2Q8BJS4 731 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lrrc56Q8K375 552 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Appl2Q8K3G9 662 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dnajc17Q91WT4 303 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tbx20Q9ES03 445 aa15.54■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Atp8b5A3FIN4 1183 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm9992B2RWK3 458 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pcdha4O88689 947 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fscn2Q32M02 492 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rasip1Q3U0S6 961 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hdac4Q6NZM9 1076 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Unc93aQ710D3 458 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trub2Q91WG3 331 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Coa7Q921H9 231 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 RragcQ99K70 398 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kcnh7Q9ER47 1195 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 TazI7HJS2 263 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NfkbieO54910 364 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hoxc6P10629 235 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hoxc13P50207 328 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 4933427I04RikQ3V053 235 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cln3Q61124 438 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ift122Q6NWV3 1182 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Znf653Q6YND2 615 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Moxd2Q7TT41 619 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zscan22Q8BGS5 496 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kcnc4Q8R1C0 628 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trim29Q8R2Q0 587 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Washc1Q8VDD8 475 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vps16Q920Q4 839 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Iqca1Q9CUL5 857 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 MsraQ9D6Y7 233 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 BcamQ9R069 622 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tulp1Q9Z273 543 aa15.53■□□□□ 0.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lamb2Q61292 1799 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.9 ms