Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
Sbf1Q6ZPE2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Sbf1Q6ZPE2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Sbf1Q6ZPE2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Sbf1Q6ZPE2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
Sbf1Q6ZPE2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Sbf1Q6ZPE2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Sbf1Q6ZPE2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Sbf1Q6ZPE2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Sbf1Q6ZPE2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Sbf1Q6ZPE2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Sbf1Q6ZPE2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Sbf1Q6ZPE2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sbf1Q6ZPE2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Sbf1Q6ZPE2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Sbf1Q6ZPE2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sbf1Q6ZPE2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Sbf1Q6ZPE2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sbf1Q6ZPE2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Sbf1Q6ZPE2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Sbf1Q6ZPE2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Sbf1Q6ZPE2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sbf1Q6ZPE2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sbf1Q6ZPE2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Sbf1Q6ZPE2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sbf1Q6ZPE2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Sbf1Q6ZPE2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Sbf1Q6ZPE2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sbf1Q6ZPE2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sbf1Q6ZPE2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Sbf1Q6ZPE2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sbf1Q6ZPE2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sbf1Q6ZPE2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sbf1Q6ZPE2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sbf1Q6ZPE2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sbf1Q6ZPE2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Sbf1Q6ZPE2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sbf1Q6ZPE2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sbf1Q6ZPE2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Sbf1Q6ZPE2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sbf1Q6ZPE2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Sbf1Q6ZPE2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Sbf1Q6ZPE2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sbf1Q6ZPE2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sbf1Q6ZPE2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Sbf1Q6ZPE2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sbf1Q6ZPE2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Sbf1Q6ZPE2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Sbf1Q6ZPE2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sbf1Q6ZPE2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Sbf1Q6ZPE2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sbf1Q6ZPE2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sbf1Q6ZPE2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sbf1Q6ZPE2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Sbf1Q6ZPE2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Sbf1Q6ZPE2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sbf1Q6ZPE2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sbf1Q6ZPE2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sbf1Q6ZPE2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sbf1Q6ZPE2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sbf1Q6ZPE2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sbf1Q6ZPE2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sbf1Q6ZPE2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sbf1Q6ZPE2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sbf1Q6ZPE2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Sbf1Q6ZPE2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sbf1Q6ZPE2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sbf1Q6ZPE2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sbf1Q6ZPE2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Sbf1Q6ZPE2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sbf1Q6ZPE2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sbf1Q6ZPE2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sbf1Q6ZPE2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sbf1Q6ZPE2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sbf1Q6ZPE2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sbf1Q6ZPE2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sbf1Q6ZPE2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sbf1Q6ZPE2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sbf1Q6ZPE2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Sbf1Q6ZPE2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sbf1Q6ZPE2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sbf1Q6ZPE2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sbf1Q6ZPE2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sbf1Q6ZPE2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sbf1Q6ZPE2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sbf1Q6ZPE2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sbf1Q6ZPE2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sbf1Q6ZPE2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sbf1Q6ZPE2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sbf1Q6ZPE2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Sbf1Q6ZPE2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sbf1Q6ZPE2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sbf1Q6ZPE2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sbf1Q6ZPE2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sbf1Q6ZPE2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sbf1Q6ZPE2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sbf1Q6ZPE2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sbf1Q6ZPE2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sbf1Q6ZPE2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sbf1Q6ZPE2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms