Protein–RNA interactions for Protein: Q61292

Lamb2, Laminin subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb2Q61292 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.44■■■■■ 4.55
Lamb2Q61292 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Lamb2Q61292 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Lamb2Q61292 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Lamb2Q61292 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Lamb2Q61292 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Lamb2Q61292 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lamb2Q61292 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Lamb2Q61292 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Lamb2Q61292 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lamb2Q61292 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lamb2Q61292 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lamb2Q61292 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Lamb2Q61292 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Lamb2Q61292 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Lamb2Q61292 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lamb2Q61292 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lamb2Q61292 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamb2Q61292 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lamb2Q61292 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lamb2Q61292 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Lamb2Q61292 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lamb2Q61292 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lamb2Q61292 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lamb2Q61292 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamb2Q61292 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lamb2Q61292 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lamb2Q61292 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lamb2Q61292 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lamb2Q61292 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Lamb2Q61292 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lamb2Q61292 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lamb2Q61292 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Lamb2Q61292 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lamb2Q61292 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Lamb2Q61292 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lamb2Q61292 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lamb2Q61292 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamb2Q61292 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lamb2Q61292 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lamb2Q61292 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lamb2Q61292 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamb2Q61292 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamb2Q61292 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Lamb2Q61292 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lamb2Q61292 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lamb2Q61292 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamb2Q61292 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamb2Q61292 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamb2Q61292 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamb2Q61292 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lamb2Q61292 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Lamb2Q61292 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lamb2Q61292 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Lamb2Q61292 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lamb2Q61292 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Lamb2Q61292 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamb2Q61292 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Lamb2Q61292 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamb2Q61292 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamb2Q61292 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamb2Q61292 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamb2Q61292 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamb2Q61292 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lamb2Q61292 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamb2Q61292 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamb2Q61292 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamb2Q61292 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamb2Q61292 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamb2Q61292 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamb2Q61292 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamb2Q61292 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamb2Q61292 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamb2Q61292 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamb2Q61292 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lamb2Q61292 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lamb2Q61292 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamb2Q61292 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamb2Q61292 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamb2Q61292 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamb2Q61292 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamb2Q61292 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamb2Q61292 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamb2Q61292 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamb2Q61292 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamb2Q61292 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamb2Q61292 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Lamb2Q61292 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamb2Q61292 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamb2Q61292 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lamb2Q61292 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Lamb2Q61292 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Lamb2Q61292 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lamb2Q61292 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lamb2Q61292 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lamb2Q61292 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Lamb2Q61292 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lamb2Q61292 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Lamb2Q61292 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lamb2Q61292 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms