RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q8C1R3 189 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam114a1Q9D281 569 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MmeQ61391 750 aa29.17■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ndst4Q9EQW8 872 aa29.17■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttll12Q3UDE2 639 aa29.17■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 D130040H23RikQ8BII3 405 aa29.17■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ces1Q8VCC2 565 aa29.17■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adam7O35227 789 aa29.16■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pdrg1P59048 133 aa29.16■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa29.16■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap4B1AUY3 965 aa29.16■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 WhrnQ80VW5 918 aa29.16■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf18Q810A1 556 aa29.16■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa29.16■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cmtr1Q9DBC3 837 aa29.16■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Setd4P58467 439 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eme2Q56A04 373 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pnma5Q5DTT8 618 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Antxr2Q6DFX2 487 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Morc2bQ8C5W4 1022 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map7d1A2AJI0 846 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mx1P09922 631 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtgdrP70263 357 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ItgadQ3V0T4 1168 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc42Q5SV66 316 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Asic3Q6X1Y6 530 aa29.15■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vcam1P29533 739 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chrna5Q2MKA5 467 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Papd7Q6PB75 542 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klra17Q9JMA4 273 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 EcsitQ9QZH6 435 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ErmardE9Q048 622 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif3cO35066 796 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trpc6Q61143 930 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt222Q8CCX5 294 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifih1Q8R5F7 1025 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tal1P22091 329 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnj4P52189 445 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 EregQ61521 162 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GnptabQ69ZN6 1235 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snx12O70493 165 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map3k12Q60700 888 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Maip1Q8BHE8 291 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Thap3Q8BJ25 218 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rcor2Q8C796 523 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 EpgnQ924X1 152 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cbx8Q9QXV1 362 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sept14Q9DA97 430 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Apol6B7ZC55 329 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Foxn2E9Q7L6 429 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Shc3Q61120 474 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plagl2Q925T4 496 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cul5Q9D5V5 780 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ptf1aQ9QX98 324 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc6O88978 473 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Evi5P97366 809 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NeblQ0II04 452 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stxbp3Q60770 592 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mettl25Q6NXH8 597 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd24Q80VM7 985 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stac3Q8BZ71 360 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp17lbE9Q9U0 468 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lig1P37913 916 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmtc1Q3UV71 942 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scnn1aQ61180 699 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RragaQ80X95 313 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DonsonQ9QXP4 560 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Magea10A2AMW4 325 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gfpt1P47856 697 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cacnb3P54285 484 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf827Q505G8 1078 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr832Q7TRG9 312 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Capza3P70190 299 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbln1Q08879 705 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hirip3Q8BLH7 601 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ThegQ9JMB1 375 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psma7Q9Z2U0 248 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Armcx3Q8BHS6 379 aa29.09■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mboat7Q8CHK3 473 aa29.09■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdk17Q8K0D0 523 aa29.09■■■□□ 2.25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.3 ms