RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-PR2P0CX60 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-DR5P0CX65 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-ER2P0CX66 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-GR3P0CX67 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-LR1P0CX68 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-MR2P0CX69 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-JR2P47099 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-DR1Q03856 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-BRQ12217 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-NL2Q12470 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-GR2Q12485 440 aa5.46□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q DSF2P38213 736 aa5.45□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAM3Q12296 706 aa5.45□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q LAM6Q08001 693 aa5.44□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q RGA1P39083 1007 aa5.43□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q CST6P40535 587 aa5.43□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTF1P53064 558 aa5.43□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q GCR2Q01722 534 aa5.43□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRN7P40992 514 aa5.42□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC4P07834 779 aa5.4□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q BRE2P43132 505 aa5.4□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q HED1Q03937 162 aa5.4□□□□□ -1.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q RGA2Q06407 1009 aa5.39□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q KEX2P13134 814 aa5.38□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q DMA1P38823 416 aa5.38□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q BDP1P46678 594 aa5.38□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIT4P20604 311 aa5.36□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q IES2P40154 320 aa5.36□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIR1P40507 360 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q TEA1P47988 759 aa5.36□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL115CP53925 644 aa5.36□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q MOD5P07884 428 aa5.35□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q NUP42P49686 430 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERF2Q06551 359 aa5.35□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q CLA4P48562 842 aa5.33□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q TUB4P53378 473 aa5.33□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q AGE1Q04412 482 aa5.33□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q PAC1P39946 494 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q TPD3P31383 635 aa5.31□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL062WQ02781 134 aa5.31□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q KXD1P53158 218 aa5.3□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q AFT1P22149 690 aa5.29□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q NIS1P53939 407 aa5.29□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q DIT2P21595 489 aa5.28□□□□□ -1.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q HST3P53687 447 aa5.27□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q ENV9Q08651 330 aa5.27□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data5.26□□□□□ -1.57not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q ASH1P34233 588 aa5.26□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q HXT10P43581 546 aa5.26□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR196WQ04336 1088 aa5.26□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q FPK1P53739 893 aa5.25□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLY41P22215 453 aa5.24□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q GAR1P28007 205 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q MET22P32179 357 aa5.24□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRD1P40454 393 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data5.24□□□□□ -1.57not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q SYH1Q02875 849 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q MET32Q12041 191 aa5.24□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTT106P40161 455 aa5.23□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPA14P50106 137 aa5.23□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q PUS6P53294 404 aa5.23□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q HST2P53686 357 aa5.23□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q ALR1Q08269 859 aa5.23□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR444WQ04093 687 aa5.22□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q PUS5Q06244 254 aa5.22□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR097WQ06839 1073 aa5.22□□□□□ -1.57
tW(UCA)QtW(UCA)Q PDC1P06169 563 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSB3P48566 633 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATF2P53296 535 aa5.21□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNR021WP53723 404 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q TBF1Q02457 562 aa5.21□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q LCB5Q06147 687 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q GLN1P32288 370 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q MMP1Q12372 583 aa5.18□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDL206WQ12424 762 aa5.18□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJR115WP47152 169 aa5.17□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM1P15565 570 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q KIP2P28743 706 aa5.16□□□□□ -1.58
tW(UCA)QtW(UCA)Q UGA3P26370 528 aa5.15□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRT4P33201 236 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM7Q12156 149 aa5.15□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q IXR1P33417 597 aa5.14□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR346CQ06139 101 aa5.14□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q SCJ1P25303 377 aa5.12□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRF1Q12516 437 aa5.12□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q PTK2P47116 818 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDL176WQ12027 708 aa5.11□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q VAC17P25591 423 aa5.1□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q GLC3P32775 704 aa5.1□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q NUP85P46673 744 aa5.1□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q ESS1P22696 170 aa5.09□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q RSC30P38781 883 aa5.09□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q ACO2P39533 789 aa5.09□□□□□ -1.59
tW(UCA)QtW(UCA)Q GLY1P37303 387 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
tW(UCA)QtW(UCA)Q OPT2Q06593 877 aa5.07□□□□□ -1.6
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJU3P28321 313 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.6 ms