RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A MAM3Q12296 706 aa2.04□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A DAT1P13483 248 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A RPL34BP40525 121 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A PUS1Q12211 544 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A CLB5P30283 435 aa2.03□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A ALA1P40825 983 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A YDR344CQ05510 147 aa2.03□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A ISM1P48526 1002 aa2.03□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A ARG82P07250 355 aa2.02□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A ARG8P18544 423 aa2.02□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A TEA1P47988 759 aa2.02□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A CAF120P53836 1060 aa2.02□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A SYH1Q02875 849 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A ALR1Q08269 859 aa2.02□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A NOP53Q12080 455 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A TBS1P38114 1094 aa2.02□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A RAM1P22007 431 aa2.01□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A SCW11P53189 542 aa2.01□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A IES2P40154 320 aa2.01□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A ILV3P39522 585 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A MIP1P15801 1254 aa2□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A CKB1P43639 278 aa2□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A LSC2P53312 427 aa2□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A HGH1P48362 394 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A BDP1P46678 594 aa1.99□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A MKS1P34072 584 aa1.98□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A AIR1P40507 360 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A YNR014WP53719 212 aa1.98□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A PBS2P08018 668 aa1.98□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A YNL115CP53925 644 aa1.98□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A YTA6P40328 754 aa1.97□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A YPR204WQ08995 1032 aa1.97□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A MAC1P35192 417 aa1.97□□□□□ -2.09
YPL060C-AYPL060C-A PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data1.96□□□□□ -2.1not detected
YPL060C-AYPL060C-A YJR115WP47152 169 aa1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A HED1Q03937 162 aa1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A MTC5Q03897 1148 aa1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A BDS1Q08347 646 aa1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A MMP1Q12372 583 aa1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A MET22P32179 357 aa1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A AHP1P38013 176 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A CST6P40535 587 aa1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A YDL206WQ12424 762 aa1.96□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A NSG2P53898 299 aa1.95□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A DLD1P32891 587 aa1.95□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A DMA1P38823 416 aa1.95□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A UBP2Q01476 1272 aa1.95□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A ENV9Q08651 330 aa1.95□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A CLA4P48562 842 aa1.94□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A SOL3P38858 249 aa1.94□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A CEM1P39525 442 aa1.94□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A APP1P53933 587 aa1.94□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A DFG5Q05031 458 aa1.94□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A GLN1P32288 370 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A PTK2P47116 818 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A LSB3P43603 459 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A STR2P47164 639 aa1.92□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A PUS6P53294 404 aa1.92□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A THI72Q08579 599 aa1.92□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A YPR015CQ12531 247 aa1.92□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A COQ2P32378 372 aa1.92□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A LAM6Q08001 693 aa1.92□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A UBP14P38237 781 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A YBL036CP38197 257 aa1.91□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A NSI1Q12457 570 aa1.91□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A AFT1P22149 690 aa1.9□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A ESS1P22696 170 aa1.9□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A TUB4P53378 473 aa1.9□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A LCB5Q06147 687 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.1
YPL060C-AYPL060C-A PAC1P39946 494 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A ATG3P40344 310 aa1.89□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A RRD1P40454 393 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A BRL1P38770 471 aa1.89□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A OPT2Q06593 877 aa1.89□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A YOR352WQ08816 343 aa1.89□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A NUP85P46673 744 aa1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A TAT1P38085 619 aa1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A MVP1P40959 511 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A ERF2Q06551 359 aa1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A TCB1Q12466 1186 aa1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A AI1P03875 834 aa1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A TRM1P15565 570 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A GLC3P32775 704 aa1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A TFB3Q03290 321 aa1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A PHM7Q12252 991 aa1.88□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A TRK2P28584 889 aa1.87□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A COX6P00427 148 aa1.86□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A SCJ1P25303 377 aa1.86□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A GUT2P32191 649 aa1.86□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A ATG14P38270 344 aa1.86□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A HXT10P43581 546 aa1.86□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A TEC1P18412 486 aa1.86□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A PSE1P32337 1089 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A CSN12P47130 423 aa1.86□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A UTR2P32623 467 aa1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.5 ms