RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeastyeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG34YOL083W KTR1P27810 393 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W RGA2Q06407 1009 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W SIT4P20604 311 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W RAM1P22007 431 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W HST2P53686 357 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W YMR196WQ04336 1088 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W GYP1Q08484 637 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W NUD1P32336 851 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W RGA1P39083 1007 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG34YOL083W TFB3Q03290 321 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W AMS1P22855 1083 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W SCJ1P25303 377 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W STR2P47164 639 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W MMP1Q12372 583 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W HGH1P48362 394 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W TRK1P12685 1235 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W KEX2P13134 814 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W ESS1P22696 170 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W BRL1P38770 471 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W ISM1P48526 1002 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W RTF1P53064 558 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG34YOL083W SAS4Q04003 481 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W ERF2Q06551 359 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W NPL4P33755 580 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W YNL115CP53925 644 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W PKC1P24583 1151 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W YJU3P28321 313 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-DR4O74302 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-AP0CX57 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-PR1P0CX58 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-ORP0CX59 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-PR2P0CX60 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-DR5P0CX65 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-ER2P0CX66 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-GR3P0CX67 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-LR1P0CX68 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-MR2P0CX69 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W SLY41P22215 453 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-JR2P47099 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-DR1Q03856 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-BRQ12217 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-NL2Q12470 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W TY1A-GR2Q12485 440 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W RAD59Q12223 238 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG34YOL083W SDH2P21801 266 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W SEC2P17065 759 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W AGE1Q04412 482 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W ARG8P18544 423 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W RSC30P38781 883 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W LAM6Q08001 693 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W PRT1P06103 763 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W YBL036CP38197 257 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W TUB4P53378 473 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W RLF2Q12495 606 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W BIO2P32451 375 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.15□□□□□ -1.26not detected
ATG34YOL083W PUS6P53294 404 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG34YOL083W TBF1Q02457 562 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG34YOL083W BIM1P40013 344 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG34YOL083W YJL007CP47080 104 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG34YOL083W CSE4P36012 229 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG34YOL083W PAC1P39946 494 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG34YOL083W RRN7P40992 514 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG34YOL083W YDL206WQ12424 762 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG34YOL083W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG34YOL083W ATG32P40458 529 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG34YOL083W ERG12P07277 443 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W RPA14P50106 137 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W PAT1P25644 796 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W PDC1P06169 563 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W TIF1P10081 395 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W YNL108CP53929 270 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W YPR097WQ06839 1073 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W ALR1Q08269 859 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W NAF1P53919 492 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W YPL062WQ02781 134 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG34YOL083W SUP45P12385 437 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ATG34YOL083W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ATG34YOL083W KXD1P53158 218 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG34YOL083W ENO2P00925 437 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ATG34YOL083W MOD5P07884 428 aa7.01□□□□□ -1.29
ATG34YOL083W BRE2P43132 505 aa7.01□□□□□ -1.29
ATG34YOL083W TPD3P31383 635 aa7□□□□□ -1.29
ATG34YOL083W RRD1P40454 393 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ATG34YOL083W HXT10P43581 546 aa7□□□□□ -1.29
ATG34YOL083W GCR2Q01722 534 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.7 ms