RNA–Protein interactions for RNA: YKR057W

RPS21A, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS21A, Length 264 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS21A	YKR057W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	BNR1	P40450	1375 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	TCB2	P48231	1178 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	ROX1	P25042	368 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	ESL2	P36168	1195 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	TRK1	P12685	1235 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	SPE2	P21182	396 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	RTG3	P38165	486 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	FKH1	P40466	484 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
RPS21A	YKR057W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	PCT1	P13259	424 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	YAP3	P38749	330 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	SCT1	P32784	759 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	EDE1	P34216	1381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS21A	YKR057W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	KRE5	P22023	1365 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	MSP1	P28737	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	YIL092W	P40497	633 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	DJP1	P40564	432 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	SAP155	P43612	1002 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	RAD2	P07276	1031 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	POL32	P47110	350 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	TAF8	Q03750	510 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	THI22	Q06490	572 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	SIR4	P11978	1358 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	RAD9	P14737	1309 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	MNN4	P36044	1178 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
RPS21A	YKR057W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	DAL5	P15365	543 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	TPD3	P31383	635 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	USO1	P25386	1790 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPS21A	YKR057W	PRD1	P25375	712 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	TEA1	P47988	759 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	CTR9	P89105	1077 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	AAD16	Q02895	342 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	APC1	P53886	1748 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	LEO1	P38439	464 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	RLF2	Q12495	606 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	RTT109	Q07794	436 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	AUS1	Q08409	1394 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	CSE4	P36012	229 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	SIS2	P36024	562 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	IPL1	P38991	367 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	HAP5	Q02516	242 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	TAP42	Q04372	366 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	CAB1	Q04430	367 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	RRT14	P40470	206 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	ITC1	P53125	1264 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	PSK1	P31374	1356 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	SRS2	P12954	1174 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	YPP1	P46951	817 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	HIM1	Q06674	414 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	NUP145	P49687	1317 aa		3.96	□□□□□ -1.77
RPS21A	YKR057W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	RKM3	P38222	552 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	CIR1	P42940	261 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	YIL177C	P40434	1758 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	YJL225C	P40889	1758 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	QCR6	P00127	147 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	PPH3	P32345	308 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS21A	YKR057W	DLD1	P32891	587 aa		3.95	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.9 ms