RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W COX6P00427 148 aa7.66□□□□□ -1.18
SNX4YJL036W SEC2P17065 759 aa7.66□□□□□ -1.18
SNX4YJL036W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
SNX4YJL036W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SNX4YJL036W AIR1P40507 360 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SNX4YJL036W MVP1P40959 511 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SNX4YJL036W VPS70P47161 811 aa7.65□□□□□ -1.18
SNX4YJL036W CLA4P48562 842 aa7.64□□□□□ -1.19
SNX4YJL036W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
SNX4YJL036W LAM6Q08001 693 aa7.62□□□□□ -1.19
SNX4YJL036W BRE2P43132 505 aa7.61□□□□□ -1.19
SNX4YJL036W YPR109WQ06104 294 aa7.6□□□□□ -1.19
SNX4YJL036W RGR1P19263 1082 aa7.59□□□□□ -1.19
SNX4YJL036W YPL062WQ02781 134 aa7.59□□□□□ -1.19
SNX4YJL036W GCR2Q01722 534 aa7.57□□□□□ -1.2
SNX4YJL036W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SNX4YJL036W RRN7P40992 514 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX4YJL036W BDP1P46678 594 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX4YJL036W CDC4P07834 779 aa7.53□□□□□ -1.2
SNX4YJL036W PAT1P25644 796 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SNX4YJL036W KEX2P13134 814 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX4YJL036W GAR1P28007 205 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SNX4YJL036W ERF2Q06551 359 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX4YJL036W HED1Q03937 162 aa7.48□□□□□ -1.21
SNX4YJL036W PBS2P08018 668 aa7.44□□□□□ -1.22
SNX4YJL036W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data7.44□□□□□ -1.22not detected
SNX4YJL036W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SNX4YJL036W PAC1P39946 494 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SNX4YJL036W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SNX4YJL036W MET22P32179 357 aa7.42□□□□□ -1.22
SNX4YJL036W CKB1P43639 278 aa7.42□□□□□ -1.22
SNX4YJL036W MOD5P07884 428 aa7.41□□□□□ -1.22
SNX4YJL036W AGE1Q04412 482 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX4YJL036W ENV9Q08651 330 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX4YJL036W CLB5P30283 435 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX4YJL036W TUB4P53378 473 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX4YJL036W MET32Q12041 191 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX4YJL036W ASH1P34233 588 aa7.36□□□□□ -1.23
SNX4YJL036W RTF1P53064 558 aa7.36□□□□□ -1.23
SNX4YJL036W MAM3Q12296 706 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX4YJL036W AFT1P22149 690 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX4YJL036W YDR444WQ04093 687 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX4YJL036W PUS5Q06244 254 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX4YJL036W YNL115CP53925 644 aa7.32□□□□□ -1.24
SNX4YJL036W SIT4P20604 311 aa7.31□□□□□ -1.24
SNX4YJL036W HST3P53687 447 aa7.31□□□□□ -1.24
SNX4YJL036W DSF2P38213 736 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX4YJL036W IES2P40154 320 aa7.29□□□□□ -1.24
SNX4YJL036W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SNX4YJL036W TEA1P47988 759 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W TPD3P31383 635 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W KXD1P53158 218 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W YDL176WQ12027 708 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W NIS1P53939 407 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W YJR115WP47152 169 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W RRD1P40454 393 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W HXT10P43581 546 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SNX4YJL036W PDC1P06169 563 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SNX4YJL036W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX4YJL036W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX4YJL036W DMA1P38823 416 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX4YJL036W DIT2P21595 489 aa7.17□□□□□ -1.26
SNX4YJL036W SLY41P22215 453 aa7.17□□□□□ -1.26
SNX4YJL036W FPK1P53739 893 aa7.17□□□□□ -1.26
SNX4YJL036W YMR196WQ04336 1088 aa7.14□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W UGA3P26370 528 aa7.12□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W RPA14P50106 137 aa7.12□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W ALR1Q08269 859 aa7.12□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W PTK2P47116 818 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W PUS6P53294 404 aa7.11□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W YPR097WQ06839 1073 aa7.11□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W YDL206WQ12424 762 aa7.11□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W KIP2P28743 706 aa7.1□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W TBF1Q02457 562 aa7.1□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W ACO2P39533 789 aa7.09□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W CAF120P53836 1060 aa7.09□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W OPT2Q06593 877 aa7.09□□□□□ -1.27
SNX4YJL036W SCJ1P25303 377 aa7.07□□□□□ -1.28
SNX4YJL036W MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SNX4YJL036W IXR1P33417 597 aa7.07□□□□□ -1.28
SNX4YJL036W SRF1Q12516 437 aa7.07□□□□□ -1.28
SNX4YJL036W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SNX4YJL036W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.06□□□□□ -1.28not detected
SNX4YJL036W HST2P53686 357 aa7.06□□□□□ -1.28
SNX4YJL036W YLR346CQ06139 101 aa7.05□□□□□ -1.28
SNX4YJL036W RTT106P40161 455 aa7.02□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W NUP85P46673 744 aa7.02□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W MMP1Q12372 583 aa7.02□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W GLY1P37303 387 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W YIR007WP40566 764 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W MIP1P15801 1254 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W ESS1P22696 170 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W VAC17P25591 423 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W SCW11P53189 542 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX4YJL036W TY1A-BLQ12266 440 aa6.97□□□□□ -1.29
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