RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W SSA2P10592 639 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W YNL115CP53925 644 aa6.55□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W VRP1P37370 817 aa6.54□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W MMP1Q12372 583 aa6.54□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W KEX2P13134 814 aa6.53□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W GCD11P32481 527 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W BCK2P33306 851 aa6.53□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W HPC2Q01448 625 aa6.52□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W SLY41P22215 453 aa6.5□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W KTR1P27810 393 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W HGH1P48362 394 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W ERF2Q06551 359 aa6.5□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W SCJ1P25303 377 aa6.5□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W SAS4Q04003 481 aa6.5□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W GYP1Q08484 637 aa6.5□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-DR4O74302 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-AP0CX57 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-ORP0CX59 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W SEC2P17065 759 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-JR2P47099 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-DR1Q03856 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-BRQ12217 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-NL2Q12470 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W TY1A-GR2Q12485 440 aa6.49□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W ESS1P22696 170 aa6.48□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W BRL1P38770 471 aa6.47□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W DMA2P53924 522 aa6.47□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HCA4YJL033W PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W XDJ1P39102 459 aa6.45□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W PUS6P53294 404 aa6.45□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W TFB3Q03290 321 aa6.44□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W YJU3P28321 313 aa6.44□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.44□□□□□ -1.38not detected
HCA4YJL033W TUB4P53378 473 aa6.44□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W LAM6Q08001 693 aa6.44□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W RRN7P40992 514 aa6.43□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W AGE1Q04412 482 aa6.43□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W TBF1Q02457 562 aa6.43□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W RAD59Q12223 238 aa6.42□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W ARG8P18544 423 aa6.42□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W RSC30P38781 883 aa6.41□□□□□ -1.38
HCA4YJL033W PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W ERG12P07277 443 aa6.37□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W PKC1P24583 1151 aa6.37□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W YDL206WQ12424 762 aa6.37□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W CSE4P36012 229 aa6.37□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W RPA14P50106 137 aa6.37□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W KXD1P53158 218 aa6.37□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W YBL036CP38197 257 aa6.36□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W ALR1Q08269 859 aa6.36□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W YPR097WQ06839 1073 aa6.34□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W SDH2P21801 266 aa6.34□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W YEL077CQ3E7X8 1277 aa6.34□□□□□ -1.39
HCA4YJL033W PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W HXT10P43581 546 aa6.32□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W MOD5P07884 428 aa6.32□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W TPD3P31383 635 aa6.32□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W YJL007CP47080 104 aa6.31□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W AMS1P22855 1083 aa6.29□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W BDP1P46678 594 aa6.28□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W TAF7Q05021 590 aa6.28□□□□□ -1.4
HCA4YJL033W NAF1P53919 492 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W BIM1P40013 344 aa6.27□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W CST6P40535 587 aa6.27□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W DPS1P04802 557 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W BIO2P32451 375 aa6.26□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W RAS1P01119 309 aa6.24□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W ATG32P40458 529 aa6.24□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W YNL108CP53929 270 aa6.24□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W SUP45P12385 437 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W TEC1P18412 486 aa6.22□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W VAC17P25591 423 aa6.22□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W FIG4P42837 879 aa6.22□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W PUS5Q06244 254 aa6.22□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W RLF2Q12495 606 aa6.22□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W TIF1P10081 395 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
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