RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SLX8	YER116C	PKC1	P24583	1151 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SLX8	YER116C	KIC1	P38692	1080 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SLX8	YER116C	SAS4	Q04003	481 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SLX8	YER116C	CDC73	Q06697	393 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SLX8	YER116C	SPC42	P36094	363 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	ATG36	P46983	293 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	RTS3	P53289	263 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	ATF2	P53296	535 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	LAM6	Q08001	693 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	BIM1	P40013	344 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	FAR11	P53917	953 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	SWE1	P32944	819 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	YJL007C	P47080	104 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	YJR008W	P47085	338 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	YDR090C	Q03193	310 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	YPR015C	Q12531	247 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	HEM3	P28789	327 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	ATG32	P40458	529 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	GYP1	Q08484	637 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	CPS1	P27614	576 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	CSC1	Q06538	782 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	TFB4	Q12004	338 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	OCA5	P38738	679 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	PEX21	P50091	288 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	DOS2	P54858	310 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	SRC1	Q03707	834 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SLX8	YER116C	AMS1	P22855	1083 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	ASF1	P32447	279 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	VPS72	Q03388	795 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	PDR1	P12383	1068 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	ITT1	Q04638	464 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	ERG12	P07277	443 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	RGA2	Q06407	1009 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	HAT1	Q12341	374 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	COX6	P00427	148 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	ORC6	P38826	435 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	YAF9	P53930	226 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	YPR204W	Q08995	1032 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	YRR1	Q12172	810 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	RAS1	P01119	309 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SLX8	YER116C	TTI1	P36097	1038 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	MDG1	P53885	366 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	GIN4	Q12263	1142 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	SDH2	P21801	266 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	NPL4	P33755	580 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	OSW7	P43611	510 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	CSN12	P47130	423 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	NNF1	P47149	201 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	TRK1	P12685	1235 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	NUD1	P32336	851 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	IPL1	P38991	367 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	CST6	P40535	587 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	ALD2	P47771	506 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	TPO2	P53283	614 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	YML083C	Q04526	418 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.36	□□□□□ -1.55	not detected
SLX8	YER116C	STR2	P47164	639 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	ISM1	P48526	1002 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	RNH70	P53331	553 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	UBX5	Q06682	500 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SLX8	YER116C	TOM20	P35180	183 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	YBL036C	P38197	257 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	BIO2	P32451	375 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	RGR1	P19263	1082 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	TSR4	P25040	408 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	PUP1	P25043	261 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	SEC20	P28791	383 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	CLB5	P30283	435 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	PPG1	P32838	368 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SLX8	YER116C	YNL108C	P53929	270 aa		5.3	□□□□□ -1.56

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