RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W YMR196WQ04336 1088 aa5.86□□□□□ -1.47
NTF2YER009W TAF7Q05021 590 aa5.86□□□□□ -1.47
NTF2YER009W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
NTF2YER009W SSA2P10592 639 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NTF2YER009W SIT4P20604 311 aa5.85□□□□□ -1.47
NTF2YER009W KTR1P27810 393 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NTF2YER009W HST2P53686 357 aa5.85□□□□□ -1.47
NTF2YER009W GLN1P32288 370 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
NTF2YER009W RAM1P22007 431 aa5.83□□□□□ -1.48
NTF2YER009W SCJ1P25303 377 aa5.83□□□□□ -1.48
NTF2YER009W NPL4P33755 580 aa5.83□□□□□ -1.48
NTF2YER009W HGH1P48362 394 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NTF2YER009W MMP1Q12372 583 aa5.83□□□□□ -1.48
NTF2YER009W TFB3Q03290 321 aa5.82□□□□□ -1.48
NTF2YER009W KEX2P13134 814 aa5.81□□□□□ -1.48
NTF2YER009W STR2P47164 639 aa5.81□□□□□ -1.48
NTF2YER009W ISM1P48526 1002 aa5.81□□□□□ -1.48
NTF2YER009W RTF1P53064 558 aa5.81□□□□□ -1.48
NTF2YER009W YNL115CP53925 644 aa5.81□□□□□ -1.48
NTF2YER009W ESS1P22696 170 aa5.8□□□□□ -1.48
NTF2YER009W BRL1P38770 471 aa5.8□□□□□ -1.48
NTF2YER009W ERF2Q06551 359 aa5.8□□□□□ -1.48
NTF2YER009W RAS1P01119 309 aa5.79□□□□□ -1.48
NTF2YER009W SLY41P22215 453 aa5.79□□□□□ -1.48
NTF2YER009W YPR015CQ12531 247 aa5.79□□□□□ -1.48
NTF2YER009W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
NTF2YER009W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
NTF2YER009W YJU3P28321 313 aa5.77□□□□□ -1.49
NTF2YER009W GCD11P32481 527 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-DR4O74302 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-AP0CX57 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-PR1P0CX58 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-ORP0CX59 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-PR2P0CX60 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-DR5P0CX65 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-ER2P0CX66 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-GR3P0CX67 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-LR1P0CX68 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-MR2P0CX69 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W PKC1P24583 1151 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-JR2P47099 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-DR1Q03856 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-BRQ12217 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-NL2Q12470 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TY1A-GR2Q12485 440 aa5.76□□□□□ -1.49
NTF2YER009W SEC2P17065 759 aa5.75□□□□□ -1.49
NTF2YER009W RAD59Q12223 238 aa5.75□□□□□ -1.49
NTF2YER009W PRT1P06103 763 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TRK1P12685 1235 aa5.74□□□□□ -1.49
NTF2YER009W ARG8P18544 423 aa5.73□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TRM1P15565 570 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
NTF2YER009W RSC30P38781 883 aa5.72□□□□□ -1.49
NTF2YER009W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data5.72□□□□□ -1.49not detected
NTF2YER009W PUS6P53294 404 aa5.72□□□□□ -1.49
NTF2YER009W LAM6Q08001 693 aa5.72□□□□□ -1.49
NTF2YER009W TUB4P53378 473 aa5.71□□□□□ -1.5
NTF2YER009W AGE1Q04412 482 aa5.71□□□□□ -1.5
NTF2YER009W GYP1Q08484 637 aa5.71□□□□□ -1.5
NTF2YER009W YBL036CP38197 257 aa5.7□□□□□ -1.5
NTF2YER009W TBF1Q02457 562 aa5.7□□□□□ -1.5
NTF2YER009W AMS1P22855 1083 aa5.69□□□□□ -1.5
NTF2YER009W RRN7P40992 514 aa5.69□□□□□ -1.5
NTF2YER009W YJL007CP47080 104 aa5.69□□□□□ -1.5
NTF2YER009W CSE4P36012 229 aa5.68□□□□□ -1.5
NTF2YER009W YPL062WQ02781 134 aa5.68□□□□□ -1.5
NTF2YER009W SAS4Q04003 481 aa5.68□□□□□ -1.5
NTF2YER009W PAT1P25644 796 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NTF2YER009W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NTF2YER009W PAC1P39946 494 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NTF2YER009W BIM1P40013 344 aa5.67□□□□□ -1.5
NTF2YER009W RLF2Q12495 606 aa5.67□□□□□ -1.5
NTF2YER009W YDL206WQ12424 762 aa5.66□□□□□ -1.5
NTF2YER009W BIO2P32451 375 aa5.65□□□□□ -1.5
NTF2YER009W ATG32P40458 529 aa5.65□□□□□ -1.5
NTF2YER009W RPA14P50106 137 aa5.65□□□□□ -1.5
NTF2YER009W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
NTF2YER009W KXD1P53158 218 aa5.63□□□□□ -1.51
NTF2YER009W PDC1P06169 563 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
NTF2YER009W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
NTF2YER009W YNL108CP53929 270 aa5.62□□□□□ -1.51
NTF2YER009W YPR097WQ06839 1073 aa5.62□□□□□ -1.51
NTF2YER009W ALR1Q08269 859 aa5.62□□□□□ -1.51
NTF2YER009W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
NTF2YER009W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
NTF2YER009W TIF1P10081 395 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
NTF2YER009W SDH2P21801 266 aa5.6□□□□□ -1.51
NTF2YER009W HXT10P43581 546 aa5.6□□□□□ -1.51
NTF2YER009W ERG12P07277 443 aa5.59□□□□□ -1.51
NTF2YER009W SUP45P12385 437 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
NTF2YER009W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
NTF2YER009W NAF1P53919 492 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
NTF2YER009W MOD5P07884 428 aa5.58□□□□□ -1.52
NTF2YER009W TPD3P31383 635 aa5.58□□□□□ -1.52
NTF2YER009W ENO2P00925 437 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
NTF2YER009W YEL077CQ3E7X8 1277 aa5.57□□□□□ -1.52
NTF2YER009W RTG2P32608 588 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
NTF2YER009W RRD1P40454 393 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
NTF2YER009W TEC1P18412 486 aa5.55□□□□□ -1.52
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